Bakalářská práce

Poloha nukleozómů a metody jejího stanovení

Nucleosome positioning and methods of its determination

Kateřina Hemalová
Anotace

V této bakalářské práci se věnuji poloze nukleozómů a prediktivním i experimentálním metodám jejího stanovení. Poloha nukleozómů v genomu je determinována hlavně deformačními vlastnostmi DNA. Matice ohýbatelnosti DNA může být použita pro predikci polohy nukleozómů z libovolné sekvence. Experimentální mapování nukleozómů obvykle zahrnuje štěpení mikrokokovou nukleázou a následné sekvencování. Experimentální …více

Abstract

In this thesis, I focus on nucleosome positioning and predictive and experimental methods of its determination. Nucleosome positioning along genome is guided primarily by deformational properties of DNA. Matrix of DNA bendability can be used for sequence-directed mapping of the nucleosomes for any sequence. Experimental mapping of nucleosomes has been performed mainly by the micrococcal nuclease digestion …více

Klíčová slova
chromatin DNA bendability histone matrix of DNA bendability nucleosome nucleosome positioning rotational position translational position histon matice ohýbatelnosti DNA nukleozóm ohýbatelnost DNA poloha nukleozómu rotační poloha translační poloha
Zadání práce
Struktura chromatinu je na své nejnižší úrovni tvořena komplexy DNA a histonů, zvaných nukleozómy. V nich je dvojitá šroubovice DNA obtočena okolo oktameru histonů (H2A, H2B, H3 a H4)2 . Nukleozómy nepředstavují jen strukturní jednotku chromatinu potřebnou ke kompaktizaci genetického materiálu, ale uplatňují se i při regulaci funkcí genetického materiálu, např. při aktivaci nebo represi aktivity genů. Cílem bakalářské práce bude podat přehled o dostupných experimentálních přístupech a počítačových predikcích, které se využívají při stanovení polohy nukleozómů a sledování změn této polohy např. v souvislosti s procesem transkripce chromatinu.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
17. 5. 2012 14:01, prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc., učo 28574
Plný text práce
1,1 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
18. 6. 2012
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc., učo 28574
ÚEB Biol PřF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

Literatura

  • TRIFONOV, Eduard. Nucleosome Positioning by Sequence, State of the Art and Apparent Finale. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS. United States: ADENINE PRESS, 2010, roč. 27, č. 6, s. 741-746. ISSN 0739-1102.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biologie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce
 
Název
Vložil
Vloženo
Práva
Archiv závěrečné práce Kateřina Hemalová PřF B-BI BIMG z0bjv/6
Hemalová, K.
13. 5. 2012
Složky
Soubory
Anotace anglicky annotation_english.txt
Hemalová, K.
13. 5. 2012
Anotace česky annotation.txt
Hemalová, K.
13. 5. 2012
Klíčová slova keywords.txt
Hemalová, K.
13. 5. 2012
Plný text práce Hemalova_BPI.pdf
Hemalová, K.
14. 5. 2012
posudek_oponent.Bartova.doc
Konopásková, M.
29. 5. 2012

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.