Disertační práce

High resolution sequence-directed mapping of nucleosomes with functional loads

Mgr. Jan Hapala
Anotace

V této dizertacní práci zkoumáme rotacní pozice nukleozomu v rídících sekvencích eukaryotických genomu: sestrihová místa, promotory obsahující TATA box a sekvence pripojené k jaderné matrix. Dále sledujeme výskyt nukleozomálního pozicního motivu ve ctyrech eukaryotických genomech. Výsledky našich analýz naznacují dosud neznámé funkce nukleozomu a jejich vliv na evoluci genomu.

Abstract

In this dissertation we have investigated the rotational positioning of nucleosomes in the regulatory sequences of eukaryotic genomes: splice junctions, promoters containing TATA box and nuclear matrix. Further, we have studied occurrence of the nucleosome positioning motif in four eukaryotic genomes. Our results indicate yet unknown functions of nucleosomes and their influence on the evolution of the genomic DNA.

Klíčová slova
chromatin nucleosome nucleosome positioning rotational positioning nucleosome mapping splice junctions splice sites promoters TATA box nuclear matrix MARs SARs chromatin nukleozom pozice nukleozomu rotacní pozice mapování nukleozomu sestrihová místa promotory jaderná matrix SARs
Zadání práce
Eukaryotic nuclear genome is mostly organized in nucleoprotein chromatin structure. The basic structural unit of chromatin is a particle composed of DNA and histones called nucleosome. The aim of the thesis is to verify the hypothesis that the strong nucleosomes are expected to mark starts of the genes, origins of replication, transposon insertion sites in case of a plant genome.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
18. 10. 2014 09:42, prof. Ing. Eduard Nikolajevič Trifonov, Ph.D.
Plný text práce
217 KB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
23. 10. 2014
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. Ing. Eduard Nikolajevič Trifonov, Ph.D.
University of Haifa

Oponenti

RNDr. Roman Hobza, PhD.
Biofyzikální ústav AV ČR, Brno a CR Haná, Olomouc
doc. RNDr. Eduard Kejnovský, CSc.
Biofyzikální ústav AV ČR, Brno
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie (čtyřleté)
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.