Diplomová práce

Protective rotational positioning of gene splicing junctions within nucleosomes

Bc. Jan Hapala
Anotace

Tato práce se zabývá analýzou DNA sekvencí a jejím cílem je zjistit, zda místa sestřihu zaujímají přenucleosomes, splice sites, splice junctions, positioning, genomic sequences, DNA, signal detectionnostně určitou polohu vůči nukleozomu.

Abstract

This thesis deals with genomic sequence analysis. The aim of this work was to find out whether the splice junctions prefer certain distance relative to nucleosomes. Such a preference was detected and described and meaning of such a phenomenon was discussed.

Klíčová slova
nucleosomes splice sites splice junctions positioning genomic sequences DNA signal detection
Zadání práce
The student will study the topic of DNA sequence analysis. He will focus on the identification of exon-intron splice junctions and on sequence patterns specific for nucleosome DNA. The purpose of this work is to analyze nucleosomal DNA in the vicinity of splice sites, examine the relation between the position of splice sites and predicted nucleosome centers and to find out whether splice junctions are preferentially positioned within nucleosome DNA.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
30. 6. 2010 11:04, doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D., učo 31298
Plný text práce
1,4 MB / soubor PDF
Přílohy (1)
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
1. 7. 2010
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D., učo 31298
KSUZD FI MU

Oponent

Mgr. Vojtěch Bystrý, Ph.D., učo 98640
BioIT CMM CEITEC MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Aplikovaná informatika
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce
 
Název
Vložil
Vloženo
Práva
Archiv závěrečné práce Jan Hapala FI N-AP BIO utd2l/8
Hapala, J.
31. 5. 2010
Složky
Soubory
Anotace anglicky annotation_english.txt
Hapala, J.
31. 5. 2010
Anotace česky annotation.txt
Hapala, J.
31. 5. 2010
Appendix Thesis_APPENDIX.pdf
Hapala, J.
29. 6. 2010
Content of the enclosed DVD DVD_content.zip
Hapala, J.
29. 6. 2010
Klíčová slova keywords.txt
Hapala, J.
31. 5. 2010
mthesis.pdf
Hapala, J.
31. 5. 2010
Posudek_oponenta Posudek_oponenta.pdf
Bystrý, V.
21. 6. 2010

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.