Diplomová práce

Návrh a implementace centrálního indexu BBMRI_CZ

Design and Implementation of Central Index for BBMRI_CZ

Bc. Ondřej Vojtíšek, učo 325192
Anotace

Diplomová práce se zaměřuje na analýzu, návrh a implementaci informatické infrastruktury pro projekt BBMRI_CZ. Projekt se zabývá podporou výzkumu nádorových onemocnění v České republice. Informatická infrastruktura má figurovat jako nástroj usnadňující používat pro výzkum biologický materiál jiných institucí. Práce obsahuje charakteristiku systémů, se kterými bude aplikace spolupracovat, a představuje řešení splňující požadavky projektu.

Abstract

The thesis focuses on analysis, proposal and implementation of IT infrastructure for BBMRI_CZ project. The project goal is to support research on a field of oncology in Czech Republic. The goal of IT infrastructure is to facilitate exchange of biological material between medical institutions. The thesis contains characteristics of systems with which the application will cooperate and proposes solution which meets project requirements.

Klíčová slova
BBMRI BBMRI_CZ BBMRI-ERIC Java EE Stripes Spring Hibernate biobanking
Zadání práce
Cílem práce je navrhnout a implementovat službu centrálního indexu pro distribuovanou národní infrastrukturu biobank BBMRI_CZ, umožňující jak přístup administrátorů pro řízení a správu biobank, tak i pro ostatní oprávněné uživatele žádající o vzorky. Práce bude zahrnovat: definici rolí uživatelů, popis struktury biobanky, analýzu a dokumentaci potřeb jednotlivých rolí uživatelů, a dokumentaci workflow práce se vzorky. Součástí práce bude také optimalizace původního návrhu datového modelu biobanky, který byl součástí původního návrhu IT infrastruktury z roku 2011.

Implementace práce bude z důvodu udržitelnosti dalšího vývoje na ÚVT MU založena na technologiích Java, Hibernate a Stripes. Zdrojový kód musí být řádně zdokumentován.

Literatura:
[1] Holub P., Greplová K., Knoflíčková D., Valík D. The Biobanking Research Infrastructurec BBMRI_CZ: a Critical Tool to Enhance. Klinická onkologie, Praha, Česká lékařská společnost J.E.Purkyně. ISSN 0862-495X, 2012, vol. 2012, no. 2, s. 2S78- 2S81.
[2] Holub P., Valík D., Vojtíšek O., Greplová K., Knoflíčková D., Nenutil R. BBMRI_CZ - Standardy pro sdílení dat, přístup k datům a IT infrastrukturu. Verze 1.5. Technická zráva BBMRI_CZ, Brno, 2014.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
27. 5. 2014 06:57, doc. RNDr. Petr Holub, Ph.D., učo 3248
Plný text práce
1,2 MB / soubor PDF
Přílohy (1)
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
23. 6. 2014
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. RNDr. Petr Holub, Ph.D., učo 3248
DKSD ÚVT MU

Oponent

doc. RNDr. Eva Hladká, Ph.D., učo 2053
KPSK FI MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Informatika
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.