PřF:FB850 Biomolecular interactions

FB850 Interactions between biomolecules

Faculty of Science
Spring 2024

Extent and Intensity

1/0/0. 1 credit(s) (plus extra credits for completion). Type of Completion: zk (examination).

Teacher(s)

prof. Mgr. Richard Štefl, Ph.D. (lecturer)

Guaranteed by

Prerequisites (in Czech)

Základní znalosti o složení a primární sekvenci proteinů a nukleových kyselin.

Course Enrolment Limitations

The course is offered to students of any study field.

Course objectives (in Czech)

Předmět si klade za cíl seznámit studenty se základními typy interakcí, kterými spolu interagují proteiny s nukleovými kyselinami, zejména RNA.

Syllabus (in Czech)

1. Struktura biomolekul – sekundární, terciární, kvartérní: Ribonukleová kyselina, Deoxyribonukleová kyselina, Proteiny
2. Rozpoznání RNA proteiny: Strukturní motivy, Sekvenční motivy
3. Metody pro studium interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami a jejich komplexů: Biochemické metody pro určení interakčních afinit, Strukturní metody pro studium interakcí na atomární úrovni, Přednosti a nevýhody jednotlivých metod
4. Vizualizační programy
5. Statické zobrazení struktur
6. Zobrazení dynamických dat – „morphing“

Literature

Raymond F. Gesteland, Thomas R. Cech: The RNA World 3rd Ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2005
Victor A. Bloomfield, Donald M. Crothers, Ignacio Tinoc, Jr.: Nucleic Acids: Structures, properties, functions, University Science Books, 1st Ed., 2000
Wolfram Saenger: Principles of Nucleic Acid Structure, Springer, 1988
Donald Voeth and Judith G. Voeth: Biochemistry 4th Ed., Willey, 2010

Teaching methods (in Czech)

Samostatné studium literatury, prezentace a diskuze

Assessment methods (in Czech)

Prezentace a diskuze studovaného problému

Language of instruction

Czech

Further Comments

The course is taught annually.
The course is taught: every week.

The course is also listed under the following terms Spring 2020, Spring 2021, Spring 2022, Spring 2023, Spring 2025.