Kurz se zaměřuje na praktické použití programu SPM12 (který běží v rámci prostředí Matlab) pro zpracování fMRI dat. Praktické ukázky jsou založeny na veřejně dostupných datasetech dostupných na webových stránkách SPM. To tedy umožňuje studentům, aby si veškeré kroky mohli sami vyzkoušet.
Přírodovědecká fakulta
Zpracování neurozobrazovacích dat pomocí softwarů Matlab a SPM12
https://is.muni.cz/ekurzy/CEIT_MAF_4 Zkopírovat odkaz do schránky
6 lekcízdarma
Přihlásit se do e-kurzu
Pokud už e-kurz studujete, přihlaste se do IS MU.
Přihlašování probíhá od 14. 2. 2022
Lektoři
Ing. Michal Mikl, Ph.D.
michal.mikl@ceitec.muni.cz
Ing. Martin Gajdoš, Ph.D.
martin.gajdos@ceitec.muni.cz
Osnova e-kurzu
- 1) základní seznámení s prací v SPM12 pod Matlab (odkud stáhnout, jak nainstalovat, jak spustit SPM12, konfigurace prostředí, cesty v Matlab, výběr souborů a adresářů v SPM, základní orientace v programu SPM12
- 2) předzpracování fMRI dat v SPM12
- 3) first-level modely (příklad blokového a even-related designu, vysvětlení prohlížení výsledků v SPM)
- 4) second level modely
- 5) Batch editor v SPM12 (návaznost kroků, tvorba celého postupu, přenos kódu do vlastních skriptů v Matlabu)
- 6) Kontrola kvality fMRI dat