- prof. Mgr. Vítězslav Bryja, Ph.D.
Ústav experimentální biologie
ředitel ústavu
- doc. Mgr. Jan Cempírek, Ph.D.
Ústav geologických věd
ředitel ústavu
- doc. Mgr. Petr Hasil, Ph.D.
Ústav matematiky a statistiky
ředitel ústavu
- prof. RNDr. Milan Chytrý, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie
ředitel ústavu
- prof. RNDr. Jana Klánová, Ph.D.
RECETOX
ředitelka ústavu
- prof. RNDr. Petr Kubíček, CSc.
Geografický ústav
ředitel ústavu
- prof. Mgr. Dominik Munzar, Dr.
Ústav fyziky kondenzovaných látek
ředitel ústavu
- prof. RNDr. Petr Skládal, CSc.
Ústav biochemie
ředitel ústavu
- Mgr. Petr Špaček, Ph.D.
Ústav fyziky Země
ředitel ústavu
- doc. Mgr. Petr Táborský, Ph.D.
Ústav chemie
ředitel ústavu
- doc. RNDr. Petra Urbanová, Ph.D.
Ústav antropologie
ředitelka ústavu
- prof. Mgr. Petr Vašina, Ph.D.
Ústav fyziky a technologií plazmatu
ředitel ústavu
- prof. Rikard von Unge, Ph.D.
Ústav teoretické fyziky a astrofyziky
ředitel ústavu
- prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul
ředitel ústavu