BLKTM0211c Techniky molekulární biologie a genetiky - cvičení

Lékařská fakulta
jaro 2018
Rozsah
15 hodin/semestr. 3 kr. Ukončení: z.
Vyučující
MUDr. Michal Jurajda, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Michal Masařík, Ph.D. (cvičící)
Dipl. Ing. Martin Piskáček, Dr. rer. nat. (cvičící)
doc. RNDr. Sabina Ševčíková, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Andrea Knight, Ph.D. (cvičící)
Garance
MUDr. Michal Jurajda, Ph.D.
Ústav patologické fyziologie – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Kontaktní osoba: Věra Ježková
Dodavatelské pracoviště: Ústav patologické fyziologie – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Rozvrh
Pá 25. 5. 10:40–11:30 B09/324, Po 4. 6. 14:20–16:50 B11/228, Út 5. 6. 14:30–16:10 B11/228, St 6. 6. 14:20–16:50 B11/228, Čt 7. 6. 13:00–15:30 B11/228, Pá 8. 6. 10:45–13:15 B11/228
Předpoklady
BLKMB011c Molek. a buněč.biologie - cv.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět má posluchače vzdělat v základních principech analytických technik molekulární biologie a genetiky.
Výstupy z učení
Po absolutoriu kurzu jsou studenti schopni:
- popsat základní metody molekulární biologie a genetiky člověka:
- diskutovat základní informace o genomu člověka a o možnostech jeho analýzy, o lidských chromosomech a vertikálním přenosu dědičnosti.
- aplikovat praktické dovednosti z cytogenetiky a klasické mendelovské genetiky člověka a základů metod molekulární genetiky.
Osnova
  • Úvodní praktikum, základní matematické a statistické dovednosti v laboratoři.
  • Informační zdroje pro molekulární biologii, databáze (Web of Science, Pubmed..), tvorba rešerší.
  • Analýza obrazu. Základy světelné mikroskopie a fotografické techniky, záznam obrazu z mikroskopu. Teorie zpracování biologického materiálu.
  • Enzymové markery v patofyziologii, analýza proteinů pomocí gelové elektroforézy.
  • Polyakrylamidová gelová elektroforéza – denaturační (SDS-PAGE). Princip metody a analýza elektroforegramů pomocí denzitometrie.
  • Western blotting a imunodetekce proteinů.
  • Teorie izolace nukleových kyselin (základní pojmy, manipulace s DNA a RNA, měření koncentrace). PCR (princip metody).
  • Detekce populačně častých genových polymorfismů na úrovni DNA (PCR, agarosové elfo).
  • Agarózová elektroforéza produktů PCR, jejich detekce a kvantifikace.
  • Tkáňové kultury - metody buněčné a molekulární biologie a biochemie.
  • Přímá sekvenace DNA a kvantitativní PCR.
  • Farmakogenomika a genová terapie.
  • Samostatná práce – referát na zadané téma z molekulární biologie a genetiky.
  • Exkurze na specializované molekulárně-biologické pracoviště.
Literatura
  • ALBERTS, Bruce. Základy buněčné biologie :úvod do molekulární biologie buňky. 1. vyd. Ústí nad Labem: Espero, 1999, xxvi, 630. ISBN 80-902906-0-4. info
Výukové metody
praktické cvičení
Metody hodnocení
Podmínkou udělení zápočtu je absolvování výuky praktických cvičení maximálně s jednou absencí a odevzdání protokolů. Další případná průběžná kontrola znalostí (zkoušení, testy) je zcela v kompetenci asistentů, případně přednostky ústavu.
Další komentáře
Všechny formy kontaktní výuky předmětu vyjma přednášek jsou povinné.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2019, jaro 2020.