F1SP1_14 Speciální praktikum z farmakogenomiky

Farmaceutická fakulta
podzim 2024

Předmět se v období podzim 2024 nevypisuje.

Rozsah
0/1/0. 1 kr. Ukončení: z.
Vyučováno kontaktně
Vyučující
PharmDr. Mgr. Alžběta Kružicová, Ph.D. (cvičící)
Garance
PharmDr. Mgr. Alžběta Kružicová, Ph.D.
Ústav farmakologie a toxikologie – Ústavy – Farmaceutická fakulta
Předpoklady
FAKULTA(FaF) || OBOR(MUSFaF)
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem předmětu je umožnit studentům získat praktické znalosti základních molekulárně-biologických metod používaných ve farmakogenomice a farmakogenetice (izolace DNA, metoda PCR, restrikční štěpení, elektroforéza na agarózovém gelu atd.).
Výstupy z učení
Student bude po absolvování předmětu schopen identifikovat a shrnout důležité rysy hlavních metod využívaných ve farmakogenomice a farmakogenetice. Dokáže prakticky provést základní molekulárně-biologické analýzy a interpretovat získané výsledky.
Osnova
  • Rámcový přehled řešených témat:
    1. Izolace genomové DNA
    2. Charakterizace DNA, stanovení její koncentrace a čistoty spektrofotometricky
    3. Elektroforéza nukleových kyselin v agarózovém gelu
    4. Stanovení genotypu pomocí PCR, PCR-REA, multiplexní PCR, real-time PCR, alelově specifické PCR
    5. Konzultace, odevzdávání protokolů
    6. Písemný test

    Izolace DNA, stanovení genotypu CCR5 metodou PCR
    Elektroforéza amplikonů CCR5, stanovení genotypu ICAM-1 metodou PCR-REA
    Restrikční štěpení amplikonů ICAM-1, elektroforéza stanovení genotypu NOD2/1007fs metodou multiplexní PCR
    Elektroforéza amplikonů multiplexní PCR, stanovení genotypu predisponujicího k celiakii metodou alelově specifické PCR
    Elektroforéza amplikonů celiakie, stanovení alely Leiden V metodou real-time PCR
Literatura
    doporučená literatura
  • Altman a kol. Principles of Pharmacogenetics and Pharmacogenomics. 2012. ISBN 9780521885379. info
  • Šmarda J. a kol. Metody molekulární biologie. 2005. ISBN 80-210-3841-1. info
  • Innocenti Federico. Pharmacogenomics - methods and protocols. 2005. ISBN 9781588294401. info
Výukové metody
Laboratorní cvičení
Metody hodnocení
Závěrečné hodnocení má formu písemného testu (10 otázek, pro úspěšné ukončení je potřeba dosáhnout alespoň 50 % z celkového počtu bodů). Během semestru je vyžadováno vypracování protokolů z jednotlivých cvičení.
Náhradní absolvování
Není možné absolvovat předmět v~náhradní podobě.
Další komentáře
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/pharm/podzim2024/F1SP1_14