PřF:C8302 Základy proteomiky - cvičení - Informace o předmětu
C8302 Základy proteomiky - cvičení
Přírodovědecká fakultajaro 2025
- Rozsah
- 0/0/3. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: k.
- Vyučující
- Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D. (cvičící)
Danuše Fridrichová (cvičící)
Mgr. Gabriela Lochmanová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D. (cvičící)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Ondrej Šedo, Ph.D. (cvičící) - Garance
- doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta - Předpoklady
- CG090 Metody v proteomice || NOW ( CG090 Metody v proteomice )
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 36 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/36, pouze zareg.: 0/36, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/36 - Mateřské obory/plány
- předmět má 7 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Cílem předmětu je prohloubit teoretické znalosti a získat praktické dovednosti v oblasti analýzy proteomu pomocí hmotnostní spektrometrie, separace proteinů, přípravy rekombinantní DNA, expreese a purifikace rekombianntních proteinů a jejich funkční analýzy.
- Výstupy z učení
- Po absolvování kurzu bude student schopen porozumět základním přístupům proteomiky z oblasti studia strukturních a funkčních vlastností proteinů pomocí technologie rekombinatních proteinů, separaci proteinů pomocí různých technik, zejména dvourozměrné elektroforézy a kapalinové chromatografie, a bude schopen porozumět principům základní techniky hmotnostní spektrometrie proteinů. Studenti budou schopni praktické aplikace těchto přístupů při řešení současných problémů základního i aplikovaného výzkumu proteinů.
- Osnova
- Hmotnostní spektrometrie proteinů (MALDI-TOF, LC-MS/MS, příprava a analýza vzorků, identifikace proteinů)
- Exprese rekombinantní DNA v E. coli
- Jedno- a vícekroková purifikace rekombinantních proteinů
- Určení čistoty a analýza rekombinantních proteinů
- Western bloting
- Práce s proteinovými databázemi
- Určení 3D konformace proteinů s podobnou sekvencí aminokyselin
- Literatura
- Výukové metody
- Praktické řešení úloh demonstrujících využití základních nástrojů současné proteomiky.
- Metody hodnocení
- Ukončení kurzu formou kolokvia. Úspěšné zakončení je podmíněno včasným dodáním všech požadovaných protokolů a absolvováním závěrečného pohovoru.
- Informace učitele
- Praktikum bude vyučováno blokově, pokud nebude oznámeno jinak, pak vždy v zápočtovém týdnu daného semestru.
- Další komentáře
- Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
- Statistika zápisu (jaro 2025, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2025/C8302