E8678 Aplikovaná analýza přežití

Přírodovědecká fakulta
podzim 2025
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučováno kontaktně
Vyučující
doc. Mgr. Zdeněk Valenta, M.Sc., M. S., Ph.D. (přednášející)
RNDr. Tomáš Pavlík, Ph.D. (přednášející)
Garance
RNDr. Tomáš Pavlík, Ph.D.
RECETOX – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Tomáš Pavlík, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: RECETOX – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
St 12:00–15:50 F01B1/709
Předpoklady
Bi5045 Biostatistika pro matematickou biologii
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem předmětu je seznámit studenty s hlavními pojmy analýzy přežití a se základními statistickými metodami a modely pro hodnocení dat o přežití. Studenti se naučí rozumět datům o přežití a jejich nejčastějším nedostatkům, naučí se sestrojit nejpoužívanější odhady a modely vysvětlující vliv proměnných na čas do výskytu sledované události. Předmět je zaměřen zejména na praktické aplikace spíše než na matematické důkazy.
Výstupy z učení
Na konci tohoto kurzu student:
- rozumí základním pojmům analýzy přežití,
- umí definovat funkci přežití a rizikovou funkci a zná funkční vazby mezi nimi,
- zná základní rozdělení pravděpodobnosti dat přežití,
- je schopen sestrojit základní odhady funkce přežití a kumulativní rizikové funkce včetně intervalu spolehlivosti,
- umí definovat a ověřit princip proporcionality rizik,
- je schopen aplikovat Mantelův-Haenszelův logrank test na data přežití dvou skupin subjektů,
- zná výhody a nevýhody neparametrických a parametrických modelů přežití,
- umí zformulovat, vysvětlit a použít modely proporcionálních rizik, model zrychleného času, Aalenův aditivní model a Grayův flexibilní model s v čase proměnnými regresními koeficienty,
- rozumí významu regresních koeficientů modelu.
Osnova
  • Základní pojmy analýzy přežití
  • Základní neparametrické odhady
  • Parametrické odhady
  • Metody pro srovnání křivek přežití
  • Relativní přežití
  • Regresní modely v analýze přežití
  • Coxův PH model
  • Aalenův aditivní model
  • Grayův flexibilní model se v čase proměnnými regresními koeficienty
Literatura
    doporučená literatura
  • Cortese G, Scheike TH, Martinussen T. Flexible survival regression modelling. Statistical Methods in Medical Research 2010; 19:5–28.
  • 1.SCHEIKE, T. H. & ZHANG, M.-J. An Additive-Multiplicative Cox-Aalen Regression Model. Scandinavian Journal of Statistics 29, (2002).
  • Valenta, Z. et al. Kidney Graft Failure and Patient Survival Modelling Based on Competing Risks Under Nonproportional Hazards. Transplant P (2022) doi:10.1016/j.transproceed.2022.02.036.
  • HOSMER, David W.; Stanley LEMESHOW a Susanne MAY. Applied survival analysis : regression modeling of time-to-event data. 2nd ed. Hoboken: Wiley-Interscience, 2008, xiii, 392. ISBN 9780471754992. info
  • MARTINUSSEN, Torben a Thomas H. SCHEIKE. Dynamic regression models for survival data. New York: Springer, 2006, xiii, 470. ISBN 0387202749. info
  • KLEIN, John P. a Melvin L. MOESCHBERGER. Survival analysis : techniques for censored and truncated data. New York: Springer, 1997, xiv, 502. ISBN 0387948295. info
  • MARUBINI, Ettore a Maria Grazia VALSECCHI. Analysing survival data from clinical trials and observational studies. Chichester: John Wiley & Sons, 1995, xvi, 414. ISBN 0471939870. info
    neurčeno
  • Martinussen, T., Holst, K. K. & Scheike, T. H. Cox regression with missing covariate data using a modified partial likelihood method. Lifetime Data Analysis 22, 570–88 (2015).
Výukové metody
Prezenční výuka, diskuze, projektový úkol pro studenty ve skupinách
Metody hodnocení
1 závěrečný písemný test (30 otázek, každá hodnocena 1 bodem, k úspěšnému zvládnutí je zapotřebí dosáhnout alespoň 25 bodů), závěrečný (skupinový) projekt, ústní zkouška v případě nezvládnutí testu.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2022, podzim 2023, podzim 2024.
  • Statistika zápisu (nejnovější)
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2025/E8678