Bi8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2012 - akreditace

Údaje z období jaro 2012 - akreditace se nezveřejňují

Rozsah
0/2. blok 5 dnů. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: kz. Jiná možná ukončení: z.
Vyučující
RNDr. Lubomír Janda, Ph.D. (cvičící)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Bi8202 Základy proteomiky && NOW( Bi8980 Exprese a purifikace proteinů )
Předpokladem pro porozumění předmětu je znalost základů biochemie nebo molekulární biologie
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 15 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/15, pouze zareg.: 0/15
Mateřské obory/plány
předmět má 21 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Toto praktické cvičení je určeno pro studenty v počáteční fázi jejich vědecké kariéry a bude se zabývat nadexpresí proteinů v prokaryotních systémech pomocí různých vektorů, strategií purifikace proteinů a jejich charakterizací. Na konci tohoto praktického kurzu studenti budou schopni používat bionformatickou analýzu k plánování správného postupu pro expresi proteinů, navrhovat primery k optimálnímu složení genu na expresi; porovnat různé vektory s odlišnými kotvičkami spolu s různými hostitelskými kmeny; sledování funkční aktivity proteinů během různých purifikačních strategií.
Osnova
  • 1. Startegie klonování do expresních plasmidů. 2. Exprese a purifikace scFv produkovaných do cytoplasmy nebo do periplasmatického prostoru. 3. Exprese a purifikace rotliných proteinů (A. pET32 – thioredoxin - chaperon/B. pRSET – His.tag/ C. pET161DEST – Gate way technologie – Lumio.tag/D. pET28 – bez kotvičky.)
Literatura
    doporučená literatura
  • PRICE, Nicholas C. a Jacqueline NAIRN. Exploring proteins : a student's guide to experimental skills and methods. Oxford: Oxford University Press, 2009, xv, 512. ISBN 9780199205707. info
Výukové metody
Laboratorní cvičení
Metody hodnocení
vypracování protokolu, test
Navazující předměty
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2011 - akreditace, jaro 2010, jaro 2011, podzim 2011.