PřF:F8510 Fyzika biopolymerů - Informace o předmětu

F8510 Fyzika biopolymerů

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

prof. RNDr. Robert Vácha, PhD. (přednášející)
Mgr. Naděžda Špačková, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Josef Humlíček, CSc.
Ústav fyziky kondenzovaných látek – Fyzikální sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD.
Dodavatelské pracoviště: Ústav fyziky kondenzovaných látek – Fyzikální sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Pá 16:00–17:50 F1 6/1014

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Biofyzika (program PřF, B-FY)

Osnova

• 1. elektrostatické interakce ve vakuu: Coulombův zákon, princip superpozice, interakce nábojů, dipólů, rotujících dipólů a indukovaných dipólů, van der Waalsova interakce
• 2. elektrostaticke interakce ve vodných prostředích: Poisson-Boltzmannova rovnice a její řešení, Debye-Huckelova teorie, Debyova stínící délka, Gouy-Chapmanova teorie, fluktuujicí náboje
• 3. interakce velkých nenabitých částic: Hamakerova konstanta, Derjaguinova aproximace, řešeni pro různé geometrie
• 4. entropické interakce: směrové entropické síly, ideální řetězec a jeho deformace, fluktuace membrány
• 5. dokončení interakcí: interakce úbytkem, hydrofobní interakce, DLVO, vodíková vazba, solný můstek, pi-interakce
• 6. polymery v roztoku: Flory-Hugginsova teorie, směs polymerů
• 7. folding: native contacts, funnel, helix-coil transition, swelling, crowding
• 8. modely biopolymerů: ab initio, atomový popis a molekulová mechanika, zhrubené simulace
• 9. radiální distribuční funkce, uspořádání látky, strukturní faktor, vazebná konstanta
• 10. solvatace molekul a iontů: vlastnosti a struktura vody, kavitačni energie, Bornova solvatačni energie

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

• Statistika zápisu (jaro 2015, nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2015/F8510