Bi3434 Zpracování výzkumných dat v antropologii

Přírodovědecká fakulta
jaro 2018
Rozsah
0/2/0. 4 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Miroslav Králík, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Lenka Polcerová, Ph.D. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Miroslav Králík, Ph.D.
Ústav antropologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Miroslav Králík, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav antropologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 16:00–17:50 Bp1,01007
Předpoklady
Bi7351, Bi8352
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 35 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/35, pouze zareg.: 0/35
Jiné omezení: Studenti 1. ročníku Bc studia antropologie
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět navazuje na předchozí předměty Základy vědecké práce a Metody antropologie I a II. Cílem předmětu je praktické cvičení studentů v přípravě a zpracování výzkumných dat pro různé typy antropologických výzkumů. Všechna cvičení probíhají v programu R (volně dostupný program).
Výstupy z učení
Student bude po absolvování předmětu schopen:
- navrhnout strukturu dat pro zvolený antropologický výzkum;
- kódovat data pro zpracování v programu R;
- čistit a transformovat surová data;
- manipulovat s daty pro účely různých analýz a vizualizací;
- provádět s základní analytické výpočty a vytvářet sekundární data;
- vizualizovat a prezentovat data pro účely odborných výstupů.
Osnova
  • 1. Program R, RStudio, načítání dat, datové formáty, typy proměnných, názvy proměnných, struktura tabulek a polí pro antropologické aplikace;
  • 2. Antropologické kategorie/faktory a jejich datová realizace; hierarchické datové struktury, intraindividuální (strana těla, distální proximálné, radiální ulnární aj.), vnitropopulační kategorie (pohlaví, třída aj.), populace; kombinace a výběry podle faktorů;
  • 3. Typy proměnných v R, jejich definice, přiřazení a použití v antropologických výzkumech;
  • 4. Vizualizace a čištění surových dat, ukládání a zamčení dat;
  • 5. Morfometrická data: body, úhly a rozměry; 2D a 3D pole dat a jejich převody;
  • 6. Základní výpočty s morfometrickými daty a jejich grafická znázornění, výpočet indexů z rozměrů, výpočet rozměrů ze souřadnic bodů ve 2D a ve 3D prostoru;
  • 7. Prostorová data z terénu a map; získávání prostorových souřadnic, znázorňování bodů na mapách a plánech, přiřazování hodnot do vizuální formy bodů;
  • 8. Časová data: formáty data a času, časové výpočty (časové intervaly) a antropologické proměnné (datum narození, věk, věk menarché, věkové kohorty vs. průřezová data);
  • 9. Párová data: stranové rozdíly (direkcionální a fluktuační asymetrie), dvojčata, sourozenci, partneři (výpočty podobností a nepodobností);
  • 10. Opakovaná měření a výpočet reliability měření pro různé typy proměnných, souvislosti přesnosti měření a výsledků měření;
  • 11. Vícenásobná a longitudinální měření (časové řady), uspořádání a výpočty s longitudinálními daty;
  • 12. Speciální typy dat: metaanalytická data, genealogická data aj.;
  • 13. Prezentování a formátování tabulkových a grafických výstupů.
Literatura
    povinná literatura
  • Venables WN, Smith DM, R Core Team. 2017. An Introduction to R Notes on R: A Programming Environment for Data Analysis and Graphics, Version 3.4.3 (2017-11-30). Available from: https://cran.r-project.org/doc/manuals/r-release/R-intro.pdf
  • R Core Team. 2017. R Data Import/Export. Version 3.4.3 Patched (2017-12-07). Available from: https://cran.r-project.org/doc/manuals/r-patched/R-data.pdf
  • KATINA, Stanislav, Miroslav KRÁLÍK a Adéla HUPKOVÁ. Aplikovaná štatistická inferencia I. Biologická antropológia očami matematickej štatistiky. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2015, 320 s. ISBN 978-80-210-7752-2. info
  • Ulijaszek SJ, Kerr DA. 1999. Anthropometric measurement error and the assessment of nutritional status. British Journal of Nutrition 82:165–177.
  • Drozd P. 2007. Cvičení z biostatistiky. Základy práce se softwarem R. Ostrava: Ostravská univerzita, Přírodovědecká fakulta.
Výukové metody
Praktické cvičení s počítačem a reálnými empirickými daty. Nácvik operací s daty pod vedením cvičícího.
Metody hodnocení
Realizace zadaného praktického úkolu operace s daty pomocí počítače a programu R.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.