Bi3434 Zpracování výzkumných dat v antropologii

Přírodovědecká fakulta
podzim 2018
Rozsah
0/2/0. 4 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Miroslav Králík, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Lenka Polcerová, Ph.D. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Miroslav Králík, Ph.D.
Ústav antropologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Miroslav Králík, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav antropologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 17. 9. až Pá 14. 12. Út 16:00–17:50 Bp1,01007
Předpoklady
Bi7351, Bi8352
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 35 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 1/35, pouze zareg.: 0/35
Jiné omezení: Studenti 1. ročníku Bc studia antropologie
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět navazuje na předchozí předměty Základy vědecké práce a Metody antropologie I a II. Cílem předmětu je praktické cvičení studentů v přípravě a zpracování výzkumných dat pro různé typy antropologických výzkumů. Všechna cvičení probíhají v programu R (volně dostupný program).
Výstupy z učení
Student bude po absolvování předmětu schopen:
- navrhnout strukturu dat pro zvolený antropologický výzkum;
- kódovat data pro zpracování v programu R;
- čistit a transformovat surová data
- manipulovat s daty pro účely různých analýz a vizualizací;
- provádět s základní analytické výpočty a vytvářet sekundární data;
- vizualizovat a prezentovat data pro účely odborných výstupů.
Osnova
  • 1. Program R, RStudio, úvod do R
  • 2. Objekty v R, datové struktury v R, jejich definice a využití při zpracovávání antropologických dat I.
  • 3. Objekty v R, datové struktury v R, jejich definice a využití při zpracovávání antropologických dat II.
  • 4. Načtení antropologických dat s ohledem na hierarchické datové struktury, intraindividuální (strana těla, radiální ulnární aj.), vnitropopulační kategorie (pohlaví, třída aj.), populace; kombinace a výběry podle faktorů.
  • 5. Vizualizace antropologických dat I.
  • 6. Vizualizace antropologických dat II.
  • 7. Vizualizace antropologických dat III.
  • 8. Morfometrická data ve 3D.
  • 9. Mapy v R - prostorová data z terénu a map; znázorňování bodů na mapách a plánech I.
  • 10. Mapy v R - prostorová data z terénu a map; znázorňování bodů na mapách a plánech II.
  • 11. Úvod do programování v R.
  • 12. Prezentování a formátování tabulkových a grafických výstupů.
  • 13. Přehled probraných kapitol, celkové zopakování učiva, závěrečné hodnocení domácích cvičení.
Literatura
    povinná literatura
  • Venables WN, Smith DM, R Core Team. 2017. An Introduction to R. Notes on R: A Programming Environment for Data Analysis and Graphics Version 3.4.2 (2017-09-28).
  • KATINA, Stanislav, Miroslav KRÁLÍK a Adéla HUPKOVÁ. Aplikovaná štatistická inferencia I. Biologická antropológia očami matematickej štatistiky. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2015, 320 s. ISBN 978-80-210-7752-2. info
  • Ulijaszek SJ, Kerr DA. 1999. Anthropometric measurement error and the assessment of nutritional status. British Journal of Nutrition 82:165–177.
  • Drozd P. 2007. Cvičení z biostatistiky. Základy práce se softwarem R. Ostrava: Ostravská univerzita, Přírodovědecká fakulta.
Výukové metody
Praktické cvičení s počítačem a reálnými empirickými daty. Nácvik operací s daty pod vedením cvičícího.
Metody hodnocení
Pro úspěšné získání zápočtu musí student vypracovat všechny Domácí úkoly na alespoň 0,75 bodu a vypracovat 3 průběžná Cvičení na alespoň 70%.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.