PřF:C2132 Úvod do bioinformatiky - semin - Informace o předmětu
C2132 Úvod do bioinformatiky - seminář
Přírodovědecká fakultajaro 2020
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. Ukončení: z.
- Vyučující
- prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Lenka Malinovská, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Josef Houser, Ph.D. (přednášející) - Garance
- prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta - Rozvrh seminárních/paralelních skupin
- C2132/01: Čt 14:00–14:50 B09/316, J. Houser, L. Malinovská
C2132/02: Čt 15:00–15:50 B09/316, J. Houser, L. Malinovská
C2132/03: Čt 13:00–13:50 B09/316, J. Houser, L. Malinovská - Předpoklady
- Základní znalosti o biomakromolekulách (proteiny, nukleové kyseliny).
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
- Cíle předmětu
- Cílem předmětu je praktické procvičení znalostí získaných v předmětu C2131 Úvod do bioinformatiky.
- Výstupy z učení
- Student bude na konci kurzu schopen: 1) Predikovat geny v DNA sekvenci. 2) Pracovat se sekvencemi proteinů a DNA. 3) Využívat predikční nástroje. 4) Využívat vizualizační nástroje.
- Osnova
- 1) Základní zdroje bioinformatických dat. 2) Genetická informace, genetický kód, kodonová tabulka. Překlad DNA sekvence. 3) Názvosloví aminokyselin a zkratky – třípísmenné, jednopísmenné. 4) Alignment. Matice. Lokální, globální alignment. 5) Identifikace ORF v sekvenci. 6) Identifikace palindromů v sekvenci. 7) RNA. 8) Distanční matice. Tvorba fylogenetických stromů. 9) Základní vlastnosti proteinů. Predikční nástroje. 10) Predikce sekundární struktury proteinu. 11) Bioinformatické nástroje pro predikci glykosylace. 12-13) Exkurze.
- Výukové metody
- Skupinové řešení úkolů, domácí úkoly.
- Metody hodnocení
- Závěrečný písemný test.
- Další komentáře
- Studijní materiály
- Statistika zápisu (jaro 2020, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2020/C2132