Bi4013 Týmový projekt z Matematické biologie a biomedicíny – biomedicínská bioinformatika

Přírodovědecká fakulta
jaro 2021
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.
Vyučující
doc. Mgr. David Bednář, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Eva Budinská, Ph.D. (přednášející)
doc. Mgr. Natália Martínková, Ph.D. (přednášející)
Maria Persico, PhD (přednášející)
doc. Ing. Vlad Popovici, PhD (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D.
RECETOX – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Mgr. Eva Budinská, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: RECETOX – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 1. 3. až Pá 14. 5. Pá 10:00–11:50 D29/347-RCX2
  • Rozvrh seminárních/paralelních skupin:
Bi4013/Projekt_1: Rozvrh nebyl do ISu vložen. D. Bednář
Bi4013/Projekt_2: Rozvrh nebyl do ISu vložen. E. Budinská
Bi4013/Projekt_3: Rozvrh nebyl do ISu vložen. N. Martínková
Bi4013/Projekt_4: Rozvrh nebyl do ISu vložen. V. Popovici
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Cíle předmětu
V průběhu předmětu studenti týmově řeší zadanou úlohu z oblasti bioinformatiky. Hlavním cílem předmětu je podpořit schopnost studentů pracovat týmově a spolupracovat na zadané úloze a realizaci jednotlivých kroků analýzy včetně prezentace výsledků.
Výstupy z učení
Student bude po absolvování předmětu schopen: - praktického nastudování biologické a bioinformatické podstaty problému a metod, - praktického provedení bioinformatického úkolu - týmové spolupráce - prezentace výsledků
Osnova
  • Zadání studentských prací bude vybráno z následujících oblastí: - analýza dat sekvenování nové generace (genomika, transkriptomika, metagenomika - mikrobiom) - analýza sekvencí DNA - analýza dat hmotnostních spektrometrie (metabolomika, proteomika) - strukturní bioinformatika - a pod
Literatura
  • KOLAJOVÁ, Lenka. Týmová spolupráce : jak efektivně vést tým pro dosažení nejlepších výsledků. 1. vyd. Praha: Grada, 2006, 105 s. ISBN 8024717646. URL info
Výukové metody
Diskuse nad zadanými úkoly, průběžné prezentace řešení.
Metody hodnocení
Kritické zhodnocení řešení zadaného úkolu.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2020, jaro 2022.