C8857c Protein Preparation and Characterization III - practice

Přírodovědecká fakulta
jaro 2022
Rozsah
0/2/0. 3 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.
Vyučující
doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. (přednášející)
Garance
doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
It is highly recommended to participate in other courses that are part of Protein Preparation and Characterization.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/10
Mateřské obory/plány
předmět má 11 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
The practical course will focus on simple and basic methodology allowing students to monitor or characterize protein-mediated interactions. The spectrum of methods will include study of protein-protein interaction by in vitro pull-down assay using purified proteins or in vivo using yeast 2-hybrid method. Example of complex protein interactions will be presented on posttranslational modification by SUMO protein. Protein-DNA interactions will be monitored by electrophoretic mobility shift assay. To study mobile enzymes on a DNA, the ability of helicases to translocate on separate DNA strands will be monitored.
Osnova
  • 1. Protein-protein interactions and post-translational modification a) pull-down b) sumoylation c) two-hybrid 2. Protein-DNA interaction and 2-hybrid a) EMSA b) 2-hybrid c) data evaluation 3. Protein-DNA interaction a) helicase assay b) data evluation
Literatura
  • MEYERS., Robert A. Encyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine, 2nd Edition. 2004. ISBN 3-527-30545-9. info
Výukové metody
Each day will start with theoretical section describing the background and use of the individual methods. The students will be then divided in group of two and they will perform all tasks practically based on available protocol.
Metody hodnocení
Each practical course will be evaluated based on the written protocols including control question. To pass the practical course each students has to successfully complete 3/4 of all experiments.
Vyučovací jazyk
Angličtina
Navazující předměty
Informace učitele
Maximum 10 students can enroll the course.
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2011 - akreditace, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2023, jaro 2024.