C7187 Experimentální onkologie

Přírodovědecká fakulta
podzim 2009
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.
Vyučující
doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (přednášející)
doc. Mgr. Roman Hrstka, Ph.D. (přednášející)
MUDr. Petr Müller, Ph.D. (přednášející)
MUDr. Rudolf Nenutil, CSc. (přednášející)
RNDr. Bořivoj Vojtěšek, DrSc. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Zdeněk Glatz, CSc.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 15:00–16:50 B09/316
Předpoklady
C4182 Biochemie II || Bi4020 Molekulární biologie
Předmět je koncipován pro studenty navazujícího magisterského, doktorského a 3. ročníku bakalářského studia oborů biochemie a molekulární biologie a genetika. Předpokládají se znalosti na úrovni základních kurzů biochemie a molekulární biologie.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Na konci předmětu by studenti měli mít přehled o biologii a biochemii nádorové buňky a měli by rozumět mechanismům maligní transformace a šíření nádorů. Měli by být schopni teoreticky aplikovat genomické a proteomické přístupy a používat základní databázové zdroje v experimentální onkologii. Studenti by dále měli být schopni vysvětlit přístupy užívané při produkci a purifikaci proteinů a vývoji protilátek, principy molekulárního klonování, genové terapie a použití terapeutických protilátek. Kromě toho by měli být schopni správně rozhodnout o použití nejvhodnějšího biologického materiálu jako jsou modelové systémy (buněčné linie), lidské tkáně, lidská plasma. Přednášející také poskytnou přehled o onkologické farmakologii včetně vývoje a testování léčiv a o použití virů. Jedna z přednášek bude zaměřena na obecné aspekty spolupráce a kariéry ve vědě.
Osnova
  • 1. [26.10.] Úvod k přednášce, organizační pokyny (Dr. Bouchal). Spolupráce a kariéra ve vědě (Dr. Vojtěšek). Chemické, biologické a fyzikální faktory vzniku nádorů. (Dr. Bouchal) Chemické karcinogeny, Amesův test. Biochemická charakteristika nádorů.
  • 2. [2.11.] Biologie nádorové buňky I (Dr. Hrstka). Mechanismy maligní transformace. Angiogeneze, tvorba metastáz. Modelové systémy v aplikovaném výzkumu. Modelové organismy. Aplikovaná biologie buňky. Modelování biologických systémů. Biologie nádorové buňky II (Dr. Hrstka). Protein p53, možnosti predikce, potenciální možnosti využití při terapii. Možnosti terapie zaměřené na buněčný cyklus.
  • 3. [9.11.] Genomické přístupy v experimentální onkologii (Dr. Hrstka). Metody založené na PCR. Možnosti čipových analýz. Genové inženýrství.
  • 4. [16.11.] Proteomické přístupy v experimentální onkologii (Dr. Bouchal). Proteinové a peptidové separační přístupy. Možnosti hmotnostní spektrometrie při identifikaci a charakterizaci proteinů. Kvantifikace proteinů a peptidů na bázi hmotnostní spektrometrie. Proteinové databázové zdroje a algoritmy: ExPASy, Human Protein atlas. Zásady pro klinické proteomické studie: plánování, provedení, statistické hodnocení, interpretace výsledků. Vyhledávání, verifikace a validace biomarkerů.
  • 5. [23.11.] Genová terapie (Dr. Müller). Choroby léčitelné pomocí genové terapie. Vektory pro genovou terapii. Perspektivy genové terapie. Viry a jejich využiti v experimentální onkologii. Charakterizace a rozdělení viru. Nádory a viry. Adenovirové a lentivirové vektory. Viry a genová terapie. Proteinové inženýrství (Dr. Müller). Studium protein-protein interakcí. „Phage display“ pro hledání protein-protein interakcí. Analýza aktivity. „Protein engineering“.
  • 6. [30.11.] Příprava a purifikace proteinů (Dr. Vojtěšek). Využití rozličných expresních systémů pro přípravu proteinů. Využití širokého spektra „Tag sekvencí“ při přípravě proteinů. Příprava proteinů pro vývoj monoklonálních protilátek. Příprava proteinů pro funkční studie. Vývoj, charakterizace a produkce protilátek (Dr. Vojtěšek). Teorie přípravy monoklonálních a polyklonálních protilátek. Imunizační schémata, používaná zvířata a vhodné antigeny. Metody přípravy monoklonálních protilátek. Metody přípravy polyklonálních protilátek. Metody charakterizace protilátek. Produkce, purifikace a značení protilátek. Využití protilátek. Oblasti aplikace monoklonálních a polyklonálních protilátek. Základní a aplikovaný výzkum. Humanizace protilátek.
  • 7. [7.12.] Použití lidského biologického materiálu ve výzkumu (Dr. Nenutil). Lidské tkáně jako zdroj informací a nástroj k validaci experimentálních biologických modelů. Možnosti použití a metody zpracování tkáňových vzorků pro účely experimentální biologie. Prediktivní a prognostická patologie. Odhad biologických vlastností a prognózy zhoubných nádorů. Biologické prediktory odpovědi na léčbu.
  • 8. [14.12.] Vývoj, testování a charakterizace léčiv (drug development) (Dr. Müller). Účinná látka, farmakodynamika, farmakokinetika. Modely používané pro „drug screening“. Knihovny chemických látek versus přírodní produkty. Kvantitativní a strukturní analýza potenciálního léčiva. Racionální vývoj léčiv. Klinické studie.
Literatura
  • REJTHAR, Aleš a Bořivoj VOJTĚŠEK. Obecná patologie nádorového růstu. 1. vyd. Praha: Grada, 2002, 206 s. ISBN 802470238X. info
Výukové metody
Přednášky odborníků z praxe spojené s dialogem přednášejícího a studentů, diskuse, odpovědi na otázky studentů. Praktické použití databázových zdrojů pomocí počítačů.
Metody hodnocení
Zkouška formou písemného testu plus krátký ústní pohovor.
Informace učitele
Z důvodu zahraničních pracovních pobytů dvou přednášejících bude výuka předmětu v podzimním semestru 2009 probíhat až od 26.10.2009 a to každé pondělí od 15:00 do cca 17:50 v posluchárně A9/316 v Univerzitním kampusu Bohunice.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2010 - akreditace, podzim 2010, podzim 2011, podzim 2011 - akreditace, podzim 2012, podzim 2013, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023, podzim 2024.