Bi1301 Botanická mikrotechnika

Přírodovědecká fakulta
podzim 2023
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
Mgr. Hana Cempírková, Ph.D. (cvičící)
Garance
Mgr. Hana Cempírková, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Naděžda Bílá
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
Bi1301/01: St 12:00–13:50 D36/209, H. Cempírková
Bi1301/02: St 14:00–15:50 D36/209, H. Cempírková
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
předmět má 9 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Hlavní cíle předmětu jsou následující:
- Seznámení se s principy mikroskopie: porozumění základních principů různých typů mikroskopů;
- Zvládnutí různých mikroskopických technik, jako je světelná mikroskopie, fázová kontrastní mikroskopie, polarizační mikroskopie atd.;
- Příprava mikroskopických vzorků: studenti se naučí, jak vhodně připravit vzorky pro mikroskopické pozorování a jak identifikovat různé typy rostlinných buněk, pletiv a orgánů;
- Barvení mikroskopických preparátů: studenti se naučí různé barvící techniky využívané při barvení rostlinného materiálu;
- Vytváření trvalých preparátů: studenti se naučí postupy nutné pro vytvoření trvalých mikroskopických preparátů;
- Výhody a omezení jednotlivých metod: studenti pochopí, jaké jsou výhody a omezení různých mikroskopických metod a kdy je vhodné použít určitou techniku;
- Aplikace v různých oborech: studenti se seznámí s využitím různých metod v různých oborech rostlinného výzkumu.
Výstupy z učení
Po absolvování tohoto praktického kurzu by studenti měli být schopni:
popsat konstrukci historického i současného světelného mikroskopu;
využívat světelný mikroskop v různých módech a různými technikami;
připravovat rozličné typy botanických mikroskopických preparátů;
dokumentovat tyto preparáty pomocí digitální mikrofotografie;
zpracovat mikrofotografie pomocí vhodného softwaru.
Osnova
  • Úvod, vývoj stavby mikroskopu, Olympus CX31, Köhlerův princip.
  • Mikroreliéfová metoda, průduchy a jejich uspořádání, vedlejší a sousední buňky.
  • Projasňování rostlinného materiálu, vývoj embrya, optické řezy, šikmé osvětlení, rozlišovací schopnost, numerická apertura.
  • Roztlakové a roztěrové preparáty, buněčný cyklus, mitóza, barvení chromozómů.
  • Histologické techniky: fixace a fixační směsi, odvodňování, infiltrace a zalévání do parafínu, řezání na mikrotomu, barvení řezů, uzavírání.
  • Interferenční kontrasty: Fázový kontrast, Nomarského diferenciální interferenční kontrast.
  • Fluorescenční mikroskopie, primární a sekundární fluorescence, imunofluorescence.
  • Metody sledování viability a klíčivosti pylu.
  • Dokumentace mikroskopických objektů: měření, kreslení, analogová a digitální mikrofotografie, videozáznam.
Literatura
    doporučená literatura
  • Plant cell biology : a practical approach. Edited by C. R. Hawes - Béatrice Satiat-Jeunemaitre. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2001, xx, 338. ISBN 0199638659. info
  • KNOZ, Jan a Věra OPRAVILOVÁ. Základy mikroskopické techniky. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 1992, 195 s. ISBN 8021004738. info
  • PAZOURKOVÁ, Zdeňka. Botanická mikrotechnika. 1. vyd. Praha: Univerzita Karlova, 1982, 166 s. info
  • KIERNAN, J. Histological and histochemical methods: Theory and practise. 1.Ed. Oxford: Pergamon Press, 1981, 344 s. info
    neurčeno
  • Plant microtechniques and protocols. Edited by Edward Chee-Tak Yeung - Claudio Stasolla - Michael John Sumner. Cham: Springer, 2015, xiv, 576. ISBN 9783319199436. info
  • LUX, Alexander, Milan BALÁŽ, Marie KUMMEROVÁ, Aleš SOUKUP, Olga VOTRUBOVÁ, Jun ABE, Shigenori MORITA a Thomas ROST. Obrazový průvodce anatomií rostlin - Visual Guide to Plant Anatomy. 1. vyd. Praha: Academia, 2017, 325 s. ISBN 978-80-200-2620-0. URL info
  • RUZIN, Steven E. Plant microtechnique and microscopy. Oxford: Oxford University Press, 1999, xi, 322. ISBN 9780195089561. info
Výukové metody
Prezentace zahrnující teoretické základy každé metody pro studium struktury rostlinných pletiv pomocí světelného mikroskopu jsou úvodem každého praktického cvičení. Vlastní praktické laboratorní cvičení vede k přípravě mikroskopických preparátů, které jsou studovány pomocí vhodné metody světelné mikroskopie. Struktura studovaných pletiv je dokumentována kresbou nebo mikrofotografií. V průběhu každého praktického cvičení studenti zhotovují protokol zahrnující jak teoretický úvod, tak výsledky analýzy mikroskopického preparátu a hodnocení dané metody.
Metody hodnocení
Kontrola vypracovaných protokolů k jednotlivým testovaným metodám, jeden test.
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2007 - akreditace, podzim 2010 - akreditace, podzim 2002, podzim 2003, podzim 2004, podzim 2005, podzim 2006, podzim 2007, podzim 2008, podzim 2009, podzim 2010, podzim 2011, podzim 2011 - akreditace, podzim 2012, podzim 2013, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2024.