E4013 Týmový projekt z Matematické biologie a biomedicíny – biomedicínská bioinformatika

Přírodovědecká fakulta
podzim 2024
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.
Vyučováno kontaktně
Vyučující
doc. Mgr. Natália Martínková, Ph.D. (přednášející)
doc. Mgr. Eva Budinská, Ph.D. (přednášející)
Ing. Vojtěch Bartoň (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D.
RECETOX – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Natália Martínková, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: RECETOX – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 10:00–11:50 D29/347-RCX2
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Anotace
V průběhu předmětu studenti týmově řeší zadanou úlohu z oblasti bioinformatiky. Hlavním cílem předmětu je podpořit schopnost studentů pracovat týmově a spolupracovat na zadané úloze a realizaci jednotlivých kroků analýzy včetně prezentace výsledků.
Výstupy z učení
Student bude po absolvování předmětu schopen: - praktického nastudování biologické a bioinformatické podstaty problému a metod, - praktického provedení bioinformatického úkolu - týmové spolupráce - prezentace výsledků
Klíčová témata
Zadání studentských prací bude vybráno z následujících oblastí: - analýza dat sekvenování nové generace (genomika, transkriptomika, metagenomika - mikrobiom) - analýza sekvencí DNA - analýza dat hmotnostních spektrometrie (metabolomika, proteomika) - strukturní bioinformatika - a pod
Studijní zdroje a literatura
  • KOLAJOVÁ, Lenka. Týmová spolupráce : jak efektivně vést tým pro dosažení nejlepších výsledků. 1. vyd. Praha: Grada, 2006, 105 s. ISBN 8024717646. URL info
Přístupy, postupy a metody používané ve výuce
Diskuse nad zadanými úkoly, průběžné prezentace řešení.
Způsob ověření výstupů z učení a požadavky na ukončení
Kritické zhodnocení řešení zadaného úkolu.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2023, jaro 2024, podzim 2025, podzim 2026.