PřF:E8600 Vícerozměrné metody - Informace o předmětu
E8600 Vícerozměrné metody
Přírodovědecká fakultapodzim 2024
- Rozsah
- 2/1/0. 3 kr. (plus ukončení). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: z.
Vyučováno kontaktně - Vyučující
- RNDr. Jiří Jarkovský, Ph.D. (přednášející)
RNDr. Danka Haruštiaková, Ph.D. (přednášející)
RNDr. Eva Koriťáková, Ph.D. (přednášející)
RNDr. Michaela Cvanová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Lucie Kubínová (cvičící)
RNDr. Simona Littnerová, Ph.D. (cvičící) - Garance
- RNDr. Jiří Jarkovský, Ph.D.
RECETOX – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Jiří Jarkovský, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: RECETOX – Přírodovědecká fakulta - Rozvrh
- Út 12:00–14:50 D29/347-RCX2
- Předpoklady
- Bi5040 Biostatistika - základní kurz nebo Bi5045 Biostatistika pro matematickou biologii a biomedicínu. Znalost základních statistických technik jednorozměrné analýzy dat, analýza rozptylu, korelační analýza, jednoduchá regresní analýza přímky
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- Biomedicínská bioinformatika (program PřF, B-MBB)
- Epidemiologie a modelování (program PřF, B-MBB)
- Matematická biologie (program PřF, B-EXB)
- Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
- Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Ekotoxikologie)
- Cíle předmětu
- Kurz je zaměřen na představení metod vícerozměrné analýzy dat se zaměřením na data biologická a klinická. Přednášené metody navazují na klasickou biostatistiku zaměřenou na jednorozměrnou analýzu dat; představeny jsou rozšíření klasických metod pro vícerozměrný prostor, hodnocení vzdálenosti a podobnosti ve vícerozměrném prostoru, shluková analýza, redukce dimenzionality dat pomocí ordinačních metod a diskriminační analýza.
- Výstupy z učení
- V závěru kurzu je student schopen: Korektně připravit datový soubor pro vícerozměrnou analýzu; Popsat vícerozměrná data; Použít vícerozměrné statistické testy; Vybrat vhodnou metriku podobnosti nebo vzdálenosti; Spočítat a vizualizovat asociační matice; Ovládat aplikaci a principy různých shlukovacích algoritmů; Ovládat aplikaci a principy různých ordinačních metod;Zvolit adekvátní metodu pro analýzu vícerozměrných dat na základě výhod a omezení jednotlivých dostupných metod; Interpretovat výsledky vícerozměrné analýzy dat.
- Osnova
- Smysl a cíle vícerozměrné analýzy dat a modelování – příklady užití vícerozměrných analýz, výhody a nevýhody vícerozměrné analýzy dat, datová matice a značení, tabulkové a grafické zpracování vícerozměrných dat.
- Maticový počet – operace s maticemi, inverzní matice, charakteristická rovnice, vlastní čísla a vektory, rozklad na singulární hodnoty (SVD).
- Vícerozměrná rozdělení pravděpodobnosti – náhodný vektor a jeho realizace, popisné statistiky, interval spolehlivosti, odlehlá pozorování.
- Vícerozměrné statistické testy – vícerozměrný t-test, vícerozměrná analýza rozptylu.
- Podobnosti a vzdálenosti ve vícerozměrném prostoru.
- Asociační matice – výpočet a vizualizace, popisná analýza, operace s asociačními maticemi (Mantelův test, MEANSIM, ANOSIM, regrese na asociačních maticích).
- Shluková analýza hierarchická – hierarchické aglomerativní shlukování, hierarchické divizivní shlukování.
- Shluková analýza nehierarchická a identifikace optimálního počtu shluků.
- Ordinační analýzy – principy redukce dimenzionality, selekce a extrakce proměnných.
- Ordinační analýzy – analýza hlavních komponent (PCA).
- Ordinační analýzy – korespondenční analýza (CA), mnohorozměrné škálování (MDS).
- Základy klasifikace dat, ucelený souhrn aplikace vícerozměrných metod v analýze dat.
- Literatura
- Legendre, P., Legendre, L. (1998) Numerical ecology. Elsevier, 2nd ed.
- ter Braak, C.J.F. (1996). Unimodal models to relace species to environment. DLO-Agricultural Mathematics Group, Wageningen
- Zar, J.H. (1998) Biostatistical analysis. Prentice Hall, London. 4th ed.
- Flury, B., Riedwyl, H. (1988) Multivariate statistics. A practical approach. Chapman and Hall, London
- Výukové metody
- Teoretické přednášky doplněné komentovanými příklady, studenti jsou podporováni v kladení otázek týkajících se probírané látky.
- Metody hodnocení
- Předmět je ukončen písemnou zkouškou zaměřenou zejména principy vícerozměrných metod, předpoklady výpočtů a jejich aplikaci.
- Informace učitele
- http://www.cba.muni.cz/vyuka/
- Další komentáře
- Předmět je vyučován každoročně.
- Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
- Statistika zápisu (nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2024/E8600