Development of capillary electrophoretic method for nucleotide and coenzyme analysis in bacterial and stem cells

MUSILOVÁ, Jindra a Zdeněk GLATZ. Development of capillary electrophoretic method for nucleotide and coenzyme analysis in bacterial and stem cells. In CHEMICA 50S. Faculty of Science, Palacký University Olomouc, 2012, s. 97-98. ISBN 978-80-244-3115-4.

Základní údaje

• Originální název: Development of capillary electrophoretic method for nucleotide and coenzyme analysis in bacterial and stem cells
• Název česky: Vývoj kapilárně elektroforetické metody pro stanovení nukleotidů a koenzymů v bakteriálních a kmenových buňkách
• Autoři: MUSILOVÁ, Jindra a Zdeněk GLATZ.
• Vydání: CHEMICA 50S, od s. 97-98, 2 s. 2012.
• Nakladatel: Faculty of Science, Palacký University Olomouc

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Stať ve sborníku
• Obor: 10600 1.6 Biological sciences
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Organizační jednotka: Přírodovědecká fakulta
• ISBN: 978-80-244-3115-4
• ISSN: 0232-0061
• Klíčová slova česky: kapilární elektroforéza, nukleotidy, koenzymy
• Klíčová slova anglicky: capillary electrophoresis, nucleotides, coenzymes

Anotace

Metabolite profiling is one of the major approaches for metabolomics studies. It involves the identification and quantitation of a group of metabolites common to a specific pathway or chemical class. Nucleotides and coenzymes represent central energetic metabolites in the complex metabolic network. As a consequence, the quantitative determination of such important compounds is fundamental in many areas of biochemical research. The concentrations of the nucleotides and coenzymes in living cells are in the micromolar concentration range therefore highly sensitive separation techniques are required for their determination. A combination of capillary zone electrophoresis (CZE) with probably the most extensively used on-line preconcentration technique – field enhanced sample stacking – allows their analysis in different cell types. Appropriate conditions for selective separation of 17 energetically important metabolites (purine, pyrimidine nucleotides, adenine coenzymes and Acetyl CoA) were found. The most dominant parameter for the analysis was pH of the background electrolyte. The optimized methodology was applied on the cell-extract of bacterium Paracoccus denitrificans and stem cell extract. The described method is suitable for determination of large group of energetically important metabolites and its utilisation depends on character of real cell samples.

Anotace česky

Byly nalezeny vhodné podmínky pro separaci purinových a pyrimidinových nukleotidů, adeninových koenzymů a acetylCoA na kapilární elektroforéze. Pro zvýšení koncentrační citlivosti byla CE kombinována s on-line prekoncentrací - field enhanced stacking.Optimalizovaná metoda byla aplikována na bezbuněčné extrakty bakterie P. denitrificans a extrakty kmenových buněk.

Návaznosti

• CZ.1.07/2.3.00/20.0182, interní kód MU(Kód CEP: EE2.3.20.0182): Název: BBC - Vytvoření multidisciplinárního výzkumného a vzdělávacího centra bioanalytických technologií (Akronym: BBC)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, BBC - Vytvoření multidisciplinárního výzkumného a vzdělávacího centra bioanalytických technologií, 2.3 Lidské zdroje ve výzkumu a vývoji

• GAP206/11/0009, projekt VaV: Název: Kapilární electroforéza jako nástroj pro metabolomické studie (Akronym: CE metabolomics)

Investor: Grantová agentura ČR, Capillary electrophoresis as a member of the metabolomic analytical toolbox