CytoPacq v2.0

SVOBODA, David, Luděk MATYSKA a Vladimír ULMAN. CytoPacq v2.0. 2013.

Základní údaje

• Originální název: CytoPacq v2.0
• Název česky: CytoPacq v2.0
• Autoři: SVOBODA, David (203 Česká republika, garant, domácí), Luděk MATYSKA (203 Česká republika, domácí) a Vladimír ULMAN (203 Česká republika, domácí).
• Vydání: 2013.

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Software
• Obor: 20200 2.2 Electrical engineering, Electronic engineering, Information engineering
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• WWW: URL
• Kód RIV: RIV/00216224:14330/13:00066205
• Organizační jednotka: Fakulta informatiky
• Klíčová slova anglicky: simulation; on-line web interface
• Technické parametry: Pro využití softwaru je nutné postupovat podle licence GNU GPL v3. Odpovědná osoba pro jednání: David Svoboda, Fakulta informatiky, Masarykova univerzita, Botanická 68a, Brno, 602 00, [e-mail], tel. [phone]
• Příznaky: Mezinárodní význam

Anotace

CytoPacq v2.0 is nontrivial extension of CytoPacq toolkit developed in 2009. Newly, the distribution of cell nuclei within the specimen can be controlled by the user. The phenomenon called uneven illumination is now based on extensive experimental measurements. The computational kernel, which is located on server-side, is now more robust and offer better communication user interface. Namely, the user is notified via e-mail if something important happens (simulation failure, simulation completed, waiting for user input). Moreover, the user can interrupt the computation. The application also offers sample large pre-generated image dataset (68 GB) which is free to use.

Návaznosti

• GBP302/12/G157, projekt VaV: Název: Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu a při diferenciaci v normě a patologii

Investor: Grantová agentura ČR, Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu a při diferenciaci v normě a patologii