KEJNOVSKÝ, Eduard a Matej LEXA. Quadruplex-forming DNA sequences spread by retrotransposons may serve as genome regulators. Mobile Genetic Elements, Landes Bioscience, 2014, roč. 4, č. 1, s. "e28084". ISSN 2159-256X. doi:10.4161/mge.28084.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Quadruplex-forming DNA sequences spread by retrotransposons may serve as genome regulators
Autoři KEJNOVSKÝ, Eduard (203 Česko, garant) a Matej LEXA (703 Slovensko, domácí).
Vydání Mobile Genetic Elements, Landes Bioscience, 2014, 2159-256X.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10608 Biochemistry and molecular biology
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Kód RIV RIV/00216224:14740/14:00075019
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.4161/mge.28084
Klíčová slova anglicky LTR retrotransposons; DNA quadruplexes; TE transcription
Štítky podil, WOS
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: Ing. Matej Lexa, Ph.D., učo 31298. Změněno: 13. 3. 2018 14:13.
Anotace
Transposable elements (TEs) are ubiquitous genome inhabitants in eukaryotes. Increasing evidence shows that TEs are involved in regulatory networks of eukaryotic cells and contribute to genome evolution. Recently, we reported that many plant long-terminal repeat (LTR) retrotransposons contain DNA quadruplex-forming sequences at precise positions inside their LTRs and that quadruplexes are better preserved in evolutionary younger elements. As quadruplexes can modulate molecular processes, quadruplexes found at specific distances upstream and downstream from the endogenous TE promoter can affect transcription of the element. Moreover, quadruplexes found in solo LTRs, as well as in 3 ends of 5-truncated copies of LINE-1 elements, can affect expression of neighboring genes. Here, we propose that this way retrotransposons can serve as vehicles for spread of DNA quadruplexes. Quadruplexes can thus fulfill a dual regulatory role to influence both the retrotransposons carrying them and the neighboring host genes, e.g., by direct effect on transcription or by modifying the local chromatin state. Additionally, four-stranded DNA structures may serve as hotspots for recombination-based genome rearrangements.
Návaznosti
ED1.1.00/02.0068, projekt VaVNázev: CEITEC - central european institute of technology
EE2.3.20.0045, projekt VaVNázev: Podpora profesního růstu a mezinárodní integrace výzkumných týmů v oblasti molekulární medicíny
VytisknoutZobrazeno: 5. 7. 2020 04:51