NECHVÁTAL, Lukáš, Helena PĚTROŠOVÁ, Linda GRILLOVÁ, Petra POSPÍŠILOVÁ, Lenka MIKALOVÁ, Radim STRNADEL, Ivana KUKLOVÁ, Martina KOJANOVÁ, Miluše KREIDLOVÁ, Daniela VAŇOUSOVÁ, Přemysl PROCHÁZKA, Hana ZÁKOUCKÁ, Alena KRCHŇÁKOVÁ a David ŠMAJS. Syphilis-causing strains belong to separate SS14-like or Nichols-like groups as defined by multilocus analysis of 19 Treponema pallidum strains. International Journal of Medical Microbiology, JENA: Urban & Fischer Verlag, 2014, roč. 304, 5-6, s. 645-653. ISSN 1438-4221. doi:10.1016/j.ijmm.2014.04.007.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Syphilis-causing strains belong to separate SS14-like or Nichols-like groups as defined by multilocus analysis of 19 Treponema pallidum strains
Autoři NECHVÁTAL, Lukáš (203 Česká republika, domácí), Helena PĚTROŠOVÁ (203 Česká republika, domácí), Linda GRILLOVÁ (203 Česká republika, domácí), Petra POSPÍŠILOVÁ (203 Česká republika, domácí), Lenka MIKALOVÁ (203 Česká republika, domácí), Radim STRNADEL (203 Česká republika), Ivana KUKLOVÁ (203 Česká republika), Martina KOJANOVÁ (203 Česká republika), Miluše KREIDLOVÁ (203 Česká republika), Daniela VAŇOUSOVÁ (203 Česká republika), Přemysl PROCHÁZKA (203 Česká republika), Hana ZÁKOUCKÁ (203 Česká republika), Alena KRCHŇÁKOVÁ (203 Česká republika) a David ŠMAJS (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání International Journal of Medical Microbiology, JENA, Urban & Fischer Verlag, 2014, 1438-4221.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Německo
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 3.614
Kód RIV RIV/00216224:14110/14:00073673
Organizační jednotka Lékařská fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1016/j.ijmm.2014.04.007
UT WoS 000339775600016
Klíčová slova anglicky Treponema pallidum; Syphilis; Yaws; Molecular typing; Multilocus analysis; SS14-like strains
Štítky EL OK
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Soňa Böhmová, učo 232884. Změněno: 26. 11. 2014 15:41.
Anotace
Treponema pallidum strains are closely related at the genome level but cause distinct diseases. Subspecies pallidum (TPA) is the causative agent of syphilis, subspecies pertenue (TPE) causes yaws while subspecies endemicum (TEN) causes bejel (endemic syphilis). Compared to the majority of treponemal genomic regions, several chromosomal loci were found to be more diverse. To assess genetic variability in diverse genomic positions, we have selected (based on published genomic data) and sequenced five variable loci, TP0304, TP0346, TPO488, TP0515 and TP0558, in 19 reference Treponema pallidum strains including all T. pallidum subspecies (TPA, TPE and TEN). Results of this multilocus analysis divided syphilitic isolates into two groups: SS14-like and Nichols-like. The SS14-like group is comprised of SS14, Grady, Mexico A and Philadelphia 1 strains. The Nichols-like group consisted of strains Nichols, Bal 73-1, DAL-1, MN-3, Philadelphia 2, Haiti B and Madras. The TP0558 locus was selected for further studies because it clearly distinguished between the SS14- and Nichols-like groups and because the phylogenetic tree derived from the TP0558 locus showed the same clustering pattern as the tree constructed from whole genome sequences. In addition, TP0558 was shown as the only tested locus that evolved under negative selection within TPA strains. Sequencing of a short fragment (573 bp) of the TP0558 locus in a set of 25 clinical isolates from 22 patients collected in the Czech Republic during 2012-2013 revealed that clinical isolates follow the SS14- and Nichols-like distribution. (C) 2014 Elsevier GmbH. All rights reserved.
Návaznosti
GAP302/12/0574, projekt VaVNázev: Celogenomové sekvencování v analýze genomů a transkriptomů patogenních bakterií rodu Treponema
Investor: Grantová agentura ČR, Standardní projekty
NT11159, projekt VaVNázev: Mapování výskytu makrolidové rezistence původce syfilis v ČR a molekulární typizace jednotlivých syfilitických kmenů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Resortní program výzkumu a vývoje - MZ III. na léta 2010 - 2015 (IGA)
VytisknoutZobrazeno: 14. 12. 2019 06:17