2015
Biochemical Space: A Language for Formal Description and Annotation of Complex Biological Processes
TROJÁK, Matej; Tadeáš DĚD; David ŠAFRÁNEK; Matej KLEMENT; Jan ČERVENÝ et. al.Základní údaje
Originální název
Biochemical Space: A Language for Formal Description and Annotation of Complex Biological Processes
Autoři
TROJÁK, Matej (703 Slovensko, domácí); Tadeáš DĚD (203 Česká republika); David ŠAFRÁNEK (203 Česká republika, garant, domácí); Matej KLEMENT (703 Slovensko); Jan ČERVENÝ (203 Česká republika) a Luboš BRIM (203 Česká republika, domácí)
Vydání
13th Conference on Computational Methods in Systems Biology, 2015
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Prezentace na konferencích
Obor
10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV
RIV/00216224:14330/15:00081135
Organizační jednotka
Fakulta informatiky
Klíčová slova anglicky
formal specification; biological systems; systems biology; rule-based language
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 5. 9. 2016 12:32, prof. RNDr. Luboš Brim, CSc.
Anotace
V originále
Biochemical Space (BCS) is a novel framework for practical description of complex biological processes. It is developed as a part of Comprehensive Modelling Platform (CMP) -- a web-based platform for modelling and analysis of biological processes. In the context of CMP, Biochemical Space glues together complicated quantitative models with an easy-to-understand but yet formal and compact qualitative description. BCS allows to specify formal and well-annotated reaction networks of chemical entities and elemental reactions onto which the mathematical models are projected. BCS is supported by a Biochemical Space Language (BCSL) that combines state-of-the-art rule-based techniques with meta-data formats developed in well-known annotation databases.
Návaznosti
| GA15-11089S, projekt VaV |
|