DŽATKO, Šimon, Michaela KRAFČÍKOVÁ, R. HANSEL-HERTSCH, T. FESSL, Radovan FIALA, Tomáš LOJA, Daniel KRAFČÍK, J.L. MERGNY, Silvie TRANTÍRKOVÁ a Lukáš TRANTÍREK. Evaluation of the Stability of DNA i-Motifs in the Nuclei of Living Mammalian Cells. Angewandte Chemie International Edition. WEINHEIM (GERMANY): Verlag Chemie, 2018, roč. 57, č. 8, s. 2165-2169. ISSN 1433-7851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/anie.201712284.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Evaluation of the Stability of DNA i-Motifs in the Nuclei of Living Mammalian Cells
Autoři DŽATKO, Šimon (703 Slovensko, domácí), Michaela KRAFČÍKOVÁ (703 Slovensko, domácí), R. HANSEL-HERTSCH (826 Velká Británie a Severní Irsko), T. FESSL (203 Česká republika), Radovan FIALA (203 Česká republika, domácí), Tomáš LOJA (703 Slovensko, domácí), Daniel KRAFČÍK (703 Slovensko, domácí), J.L. MERGNY (250 Francie), Silvie TRANTÍRKOVÁ (203 Česká republika, domácí) a Lukáš TRANTÍREK (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Angewandte Chemie International Edition, WEINHEIM (GERMANY), Verlag Chemie, 2018, 1433-7851.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10608 Biochemistry and molecular biology
Stát vydavatele Německo
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 12.257
Kód RIV RIV/00216224:14740/18:00100847
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1002/anie.201712284
UT WoS 000424879400024
Klíčová slova anglicky DNA; i-motifs; in-cell NMR spectroscopy; structural biology
Štítky CF CELLIM, CF NMR, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 13:16.
Anotace
C-rich DNA has the capacity to form a tetra-stranded structure known as an i-motif. The i-motifs within genomic DNA have been proposed to contribute to the regulation of DNA transcription. However, direct experimental evidence for the existence of these structures invivo has been missing. Whether i-motif structures form in complex environment of living cells is not currently known. Herein, using state-of-the-art in-cell NMR spectroscopy, we evaluate the stabilities of i-motif structures in the complex cellular environment. We show that i-motifs formed from naturally occurring C-rich sequences in the human genome are stable and persist in the nuclei of living human cells. Our data show that i-motif stabilities invivo are generally distinct from those invitro. Our results are the first to interlink the stability of DNA i-motifs invitro with their stability invivo and provide essential information for the design and development of i-motif-based DNA biosensors for intracellular applications.
Návaznosti
GA16-10504S, projekt VaVNázev: Charakterizace struktury nukleových kyselin v komplexním prostředí živých buněk pomocí vysoce rozlišené NMR spektroskopie
Investor: Grantová agentura ČR, Charakterizace struktury nukleových kyselin v komplexním prostředí živých buněk pomocí vysoce rozlišené NMR spektroskopie
LM2015043, projekt VaVNázev: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (Akronym: CIISB)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology
LM2015062, projekt VaVNázev: Národní infrastruktura pro biologické a medicínské zobrazování
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, National research infrastructure for biological and medical imaging
LM2015064, projekt VaVNázev: Český národní uzel Evropské infrastruktury pro translační medicínu (Akronym: EATRIS-ERIC-CZ)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Involvement of Czech Translational Medicine Infrastructure to the European Advanced Translational Research Infrastructure in Medicine
LQ1601, projekt VaVNázev: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020
2535, interní kód MUNázev: Cellular Structural Biology of non-B DNA Motifs in Human Genome
Investor: EMBO (European Molecular Biology Organization), Cellular Structural Biology of non-B DNA Motifs in Human Genome
653706, interní kód MUNázev: iNEXT - Infrastructure for NMR, EM and X-ray crystallography for translational research (Akronym: iNEXT)
Investor: Evropská unie, iNEXT - Infrastructure for NMR, EM and X-ray crystallography for translational research, RI Research Infrastructures (Excellent Science)
VytisknoutZobrazeno: 23. 5. 2024 22:39