FALK, Martin, I FALKOVÁ, O KOPEČNÁ, A BAČÍKOVÁ, E PAGÁČOVÁ, D ŠIMEK, M GOLAN, Stanislav KOZUBEK, M PEKAROVÁ, Follett SE, B KLEJDUS, Elliott KW, K VARGA, O TEPLÁ a I KRATOCHVÍLOVÁ. Chromatin architecture changes and DNA replication fork collapse are critical features in cryopreserved cells that are differentially controlled by cryoprotectants. Scientific reports. London: NATURE PUBLISHING GROUP, roč. 8, č. 1, s. Article number 14694. ISSN 2045-2322. doi:10.1038/s41598-018-32939-5. 2018.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Chromatin architecture changes and DNA replication fork collapse are critical features in cryopreserved cells that are differentially controlled by cryoprotectants
Autoři FALK, Martin, I FALKOVÁ, O KOPEČNÁ, A BAČÍKOVÁ, E PAGÁČOVÁ, D ŠIMEK, M GOLAN, Stanislav KOZUBEK, M PEKAROVÁ, Follett SE, B KLEJDUS, Elliott KW, K VARGA, O TEPLÁ a I KRATOCHVÍLOVÁ.
Vydání Scientific reports, London, NATURE PUBLISHING GROUP, 2018, 2045-2322.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 4.011
Doi http://dx.doi.org/10.1038/s41598-018-32939-5
UT WoS 000446035900024
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: doc. RNDr. Martin Falk, Ph.D., učo 9835. Změněno: 19. 12. 2019 13:41.
Anotace
In this work, we shed new light on the highly debated issue of chromatin fragmentation in cryopreserved cells. Moreover, for the first time, we describe replicating cell-specific DNA damage and higher-order chromatin alterations after freezing and thawing. We identified DNA structural changes associated with the freeze-thaw process and correlated them with the viability of frozen and thawed cells. We simultaneously evaluated DNA defects and the higher-order chromatin structure of frozen and thawed cells with and without cryoprotectant treatment. We found that in replicating (S phase) cells, DNA was preferentially damaged by replication fork collapse, potentially leading to DNA double strand breaks (DSBs), which represent an important source of both genome instability and defects in epigenome maintenance. This induction of DNA defects by the freeze-thaw process was not prevented by any cryoprotectant studied. Both in replicating and non-replicating cells, freezing and thawing altered the chromatin structure in a cryoprotectant-dependent manner. Interestingly, cells with condensed chromatin, which was strongly stimulated by dimethyl sulfoxide (DMSO) prior to freezing had the highest rate of survival after thawing. Our results will facilitate the design of compounds and procedures to decrease injury to cryopreserved cells.
Návaznosti
GA16-12454S, projekt VaVNázev: Charakterizace a modifikace komplexní odpovědi buněk nádorů hlavy a krku na různá záření - krok kupředu ke kombinované personalizované (radio)terapii
Investor: Grantová agentura ČR, Charakterizace a modifikace komplexní odpovědi buněk nádorů hlavy a krku na různá záření - krok kupředu ke kombinované personalizované (radio)terapii
NV16-29835A, projekt VaVNázev: Molekulárně-genetické markery predikce účinnosti radioterapie u nádorů hlavy a krku
VytisknoutZobrazeno: 28. 3. 2024 15:20