R 2025

TarMi (Target and Mill)

NOVÁČEK, Jiří; Pavel KŘEPELKA; David MAKOVSKÝ a Karel ŠKUBNÍK

Základní údaje

Originální název

TarMi (Target and Mill)

Vydání

2025

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Software

Obor

21100 2.11 Other engineering and technologies

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14740/25:00143261

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

Klíčová slova anglicky

cryo-FIB;lamella preparation;targeting;focused ion beam;cryo-electron microscopy;software

Technické parametry

TarMi (Target and Mill) je otevřený softwarový nástroj určený pro podporu cílení a přípravy lamel v cryo-FIB/SEM workflow. Software umožňuje práci s obrazovými daty z elektronové a iontové mikroskopie, podporuje definici oblastí zájmu, transformace souřadnic mezi zobrazovacími režimy a systematické plánování kroků FIB opracování. Nástroj je implementován jako skriptový/softwarový balík v jazyce Python a je navržen pro integraci do existujících cryo-EM a cryo-FIB pracovních postupů. Zdrojový kód je veřejně dostupný.

Štítky

Změněno: 2. 3. 2026 21:53, Mgr. Eva Dubská

Anotace

V originále

TarMi (Target and Mill) is a software tool designed to support targeting and focused ion beam milling during cryo-lamella preparation. The tool facilitates definition of regions of interest, coordinate transformations, and systematic planning of milling steps, improving robustness and efficiency of cryo-FIB workflows.

Návaznosti

LX22NPO5104, projekt VaV
Název: Národní institut pro výzkum metabolických a kardiovaskulárních onemocnění (Akronym: CarDia)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Národní institut pro léčbu metabolických a kardiovaskulárních onemocnění, 5.1 EXCELES