PANTŮČEK, Roman, Petr PETRÁŠ, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Roman RYBÁŘ a Jiří DOŠKAŘ. Variabilita genomu kmenů multirezistentního poddruhu Staphylococcus hominis subsp. novobiosepticus v České republice. In 22nd Congress of the Czechoslovak Society for Microbiology - Health and Microorganisms. Košice - Praha: Czechoslovak Society for Microbiology, 2001, s. 266. Abstract Book.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Variabilita genomu kmenů multirezistentního poddruhu Staphylococcus hominis subsp. novobiosepticus v České republice
Název anglicky Genomic variability of multiresistant subspecies Staphylococcus hominis subsp. novobiosepticus strains in the Czech Republic
Autoři PANTŮČEK, Roman, Petr PETRÁŠ, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Roman RYBÁŘ a Jiří DOŠKAŘ.
Vydání Košice - Praha, 22nd Congress of the Czechoslovak Society for Microbiology - Health and Microorganisms, s. 266-266, Abstract Book, 2001.
Nakladatel Czechoslovak Society for Microbiology
Další údaje
Originální jazyk čeština
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Slovensko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV RIV/00216224:14310/01:00005402
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Změnil Změnil: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842. Změněno: 23. 1. 2002 10:55.
Anotace
Staphylococcus hominis subsp. novobiosepticus (SHN) je nový nedávno popsaný koaguláza-negativní poddruh [1], který bývá izolován z klinického materiálu hu-mánního původu, především z hemokultur. Kmeny jsou silně virulentní a všechny vykazují multirezistenci k antibiotikům. SHN je důležitým nosokomiálním agens [2], zatím je však přehlížený, jak u nás, tak i v zahraničních mikrobiologic-kých laboratořích. Do konce května 2001 bylo v České republice zachyceno 139 kmenů. Cílem práce bylo stanovit fenotypovou a genetickou variabilitu u 70 kmenů izolovaných v letech 1996-2000 celkem v 13 laboratořích klinické mikrobiologie v ČR. Identifikace kmenů byla provedena pomocí systémů STAPHYTest 16, API Staph a diskového testu na rezistenci k novobiocinu (disk 5 mg). Studované kmeny vykazovaly následující rezistence k antibiotikům stanovené diskovou metodou: oxacilin (98 % kmenů), erytromycin (91 %), klindamycin (95 %), ciprofloxacin (92 %), chloramfenikol (82 %), gentamicin (77 %), amoxicilin s klavulanovou kyselinou (77 %), tetracyklin (20 %), rifampicin (27 %), teikoplanin (3 %). Rezis-tence k oxacilinu byla potvrzena PCR-amplifikací mecA genu, při které byl získán pozitivní výsledek i u 2 citlivých kmenů. Při stanovení genetické variability kmenů byly testovány následující metody: analýza plazmidových profilů, PCR-ribotypizace, AP-PCR (s primery RW3A, BG2, EP017, ERIC1, ERIC2), amplifika-ce inzerčních elementů IS256 a makrorestrikční analýza. Nejpřesnějších výsledků bylo dosaženo pomocí makrorestrikční analýzy provedené pulzní gelovou elektro-forézou (PFGE), která umožnila jednoznačně odlišit kmeny SHN od druhého pod-druhu S. hominis subsp. hominis na hladině podobnosti 25%. Podobnost makrore-strikčních spekter genomové DNA se u SHN pohybovala v rozmezí 35-100 % s použitím restriktázy SmaI a 45-100% s KspI. U 70 studovaných kmenů bylo iden-tifikováno 32 makrorestrikčních profilů, které je možno rozdělit na základě sesta-veného dendrogramu do 14 klonálních typů. PFGE se jeví vzhledem k nejvyšší diskriminační schopnosti z použitých metod jako nejvhodnější metoda pro studium molekulární epidemiologie u SHN.
Anotace anglicky
in Czech
Návaznosti
GA301/99/D075, projekt VaVNázev: Genotypová diagnostika a typizace klinicky významných koaguláza negativních stafylokoků
Investor: Grantová agentura ČR, Genotypová diagnostika a typizace klinicky významných koaguláza negativních stafylokoků
MSM 143100008, záměrNázev: Genomy a jejich funkce
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Genomy a jejich funkce
VytisknoutZobrazeno: 27. 7. 2024 14:00