Genetická příbuznost kmenů Enterococcus faecium VanA u pacientů s hemato-onkologickým onemocněním

KOLÁŘ, Milan, Roman PANTŮČEK, Iva VÁGNEROVÁ, Michela KESSELOVÁ, Pavel SAUER, Ivana MATOUŠKOVÁ, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jiří DOŠKAŘ. Genetická příbuznost kmenů Enterococcus faecium VanA u pacientů s hemato-onkologickým onemocněním. Klinická mikrobiologie a infekční lékařství. Praha: TRIOS, spol. s r.o., 2003, roč. 9, č. 6, s. 284-288. ISSN 1211-264X.

Základní údaje

• Originální název: Genetická příbuznost kmenů Enterococcus faecium VanA u pacientů s hemato-onkologickým onemocněním
• Název anglicky: Molecular-biology analysis of Enterococcus faecium VanA strains in hemato-oncological patients
• Autoři: KOLÁŘ, Milan (203 Česká republika), Roman PANTŮČEK (203 Česká republika, garant), Iva VÁGNEROVÁ (203 Česká republika), Michela KESSELOVÁ (703 Slovensko), Pavel SAUER (203 Česká republika), Ivana MATOUŠKOVÁ (203 Česká republika), Vladislava RŮŽIČKOVÁ (203 Česká republika) a Jiří DOŠKAŘ (203 Česká republika).
• Vydání: Klinická mikrobiologie a infekční lékařství, Praha, TRIOS, spol. s r.o. 2003, 1211-264X.

Další údaje

• Originální jazyk: čeština
• Typ výsledku: Článek v odborném periodiku
• Obor: Genetika a molekulární biologie
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• WWW: URL
• Kód RIV: RIV/00216224:14310/03:00008507
• Organizační jednotka: Přírodovědecká fakulta
• Klíčová slova anglicky: Enterococcus faeciun; vancomycin resistance; molecular diagnostics
• Štítky: Enterococcus faeciun, Molecular diagnostics, vancomycin resistance
• Příznaky: Recenzováno

Anotace

Cíl: Cílem předložené práce byla molekulárně-biologická analýza kmenů Enterococcus faeciumVanA, izolovaných z klinického materiálu pacientů Hemato-onkologické kliniky Fakultní nemocnice Olomouc v období 1997-2002, z prostředí uvedené kliniky a formulace hypotézy o zdroji a šíření VRE. Materiál a metody: Z klinického materiálu pacientů byly standardními kultivačními metodami izolovány a identifikovány enterokoky, včetně stanovení citlivosti k antibiotikům. Molekulárně biologická analýza byla provedena u vankomycin-rezistentních kmenů E. faecium s fenotypem VanA. Ke stanovení příbuznosti kmenů byla použita makrorestrikční analýza celkové chromozomální DNA naštěpené restrikční endonukleázou SmaI. Výsledky: Celkem bylo ve sledovaném období izolováno 2 647 kmenů Enterococcus sp., přičemž 121 kmenů (4,6 %) bylo identifikováno jako VRE. Nejčastěji se jednalo o kmeny E. faeciumVanA (78 %) a E. faecalis VanB (10 %). Z prostředí uvedené kliniky, včetně biologického materiálu ošetřujícího personálu, bylo izolováno 5 vankomycin-rezistentních kmenů E. faeciumVanA. SmaI makrorestrikční spektrum genomové DNA analyzovaných kmenů Enterococcus faeciumVanA tvořilo více než 25 fragmentů o velikosti od 18 do 470 kb. U 60 kmenů bylo identifikováno 28 jedinečných restrikčních profilů, jejichž podobnost se pohybovala od 62 do 97 %. Mezi těmito profily byly dále identifikovány 4 často zastoupené klonální typy, obsahující 5 a více kmenů, s podobností DNA-profilu 90 % a vyšší. Diskuze a závěr: Na základě získaných výsledků lze předpokládat endogenní i exogenní původ izolovaných kmenů E. faeciumVanA. Lze potvrdit možnost přežívání těchto kmenů v prostředí nemocničního oddělení a následný přenos na hospitalizované pacienty. Současně je však nutné připustit i endogenní původ těchto kmenů a následnou selekci vlivem širokospektré antibiotické léčby.

Anotace anglicky

Aim of the study: The aim of this work was the molecular-biology analysis of Enterococcus faeciumVanA strains that were isolated from clinical material of the patients hospitalized at the Department of Hemato-Oncology (DHO) of the Teaching Hospital in Olomouc (Czech Republic) from 1997 to 2002, from the environment of this department and formulation of the hypothesis on the source and spread of the VRE. Material and methods: Enterococci were isolated and identified using conventional methods of cultivation including determination of antibiotic susceptibility. Molecular-biology analysis was performed in vancomycin-resistant E. faeciumVanA strains isolated in various patients and from the environment of the DHO. A macrorestrictional analysis of the total chromosomal DNA that was broken by the restriction endonucleasis SmaI was used for the determination of the relationship of strains. This analysis was performed by pulse gel electrophoresis (CHEF, Mapper, Bio-Rad) that was followed by statistical processing of the restriction profiles by pooled analysis (Gel Compar, Applied Maths). Results: 2 647 strains of Enterococcus sp.were isolated during the follow-up period totally and 121 strains of them (4.6 %) were identified as VRE. Most common strains were E. faeciumphenotype VanA (78 %) and E. faecalisphenotype VanB (10 %). Five strains of E. faecium VanA were isolated from the environment of the DHO including nasal swabs, hair and uniforms of health care providers. Twenty five to thirty three fragments sized 18 to 470 kb originate in SmaI macrorestrictional spectrum of genomic DNA of 60 E. faecium VanA strains and 28 unique restrictional profiles were identified, whose similarity varied from 62 to 97 %. Four frequently presented clonal types with 5 and more strains, whose similarity of DNA-profile was 90 %, were identified among these profiles. Three from five E. faecium VanA strains isolated from the environment had a unique profile that was not similar to any of clinical isolates and two strains are identical with the strains isolated from the patients. Conclusion: Based on the obtained results, both endogenous and exogenous origins of isolated E. faecium VanA could be supposed. Possibility of survival of these strains in the hospital department environment and subsequent transmission on hospitalized patients could be confirmed. Simultaneously, endogenous origin of these strains and subsequent selection caused by wide-spectral antibiotic treatment should be admitted.

Návaznosti

• GA301/02/1505, projekt VaV: Název: Molekulární diagnostika, epidemiologie a klasifikace klinicky významných grampozitivních koků

Investor: Grantová agentura ČR, Molekulární diagnostika, epidemiologie a klasifikace klinicky významných grampozitivních koků

• MSM 143100008, záměr: Název: Genomy a jejich funkce

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Genomy a jejich funkce