D 2004

High-Resolution Cytometry Network Project: Client/Server System for 3D Optical Microscope Data Storage and Analysis

MATULA, Pavel; Petr MATULA; Michal KOZUBEK a Petr MEJZLÍK

Základní údaje

Originální název

High-Resolution Cytometry Network Project: Client/Server System for 3D Optical Microscope Data Storage and Analysis

Název česky

Projekt Síťové cytometrie s vysokým rozlišením: Klient/server system pro 3D optickou mikroskopii

Autoři

Vydání

Los Alamitos, 2nd International Symposium on 3D Data Processing, Visualization, and Transmission, od s. 580-583, 4 s. 2004

Nakladatel

IEEE Computer Society

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Forma vydání

tištěná verze "print"

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14330/04:00010341

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

ISBN

0-7695-2223-8

Klíčová slova anglicky

3d image processing; high-resolution cytometry

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 12. 2. 2018 15:06, doc. RNDr. Petr Matula, Ph.D.

Anotace

V originále

If several laboratories work in the same field and need to cooperate, it is necessary to exchange and mutually compare their computer results. The quick way to solve this problem is to unite their file formats (if it is practicable) or to install new software systems, which are data or file format compatible. A much better solution is to use only one common system. This article describes the architecture of a new client-server system, which offers possibilities of effective cooperation for laboratories doing the research in the field of the spatial organization of human genome. However, the system design is determined mainly by optical microscopy principles and therefore the system can easily be modified for use in other applications or environments. The most pressing problem during the system design was how to share and process large 3D image data in client-server architecture.

Česky

Pokud pracuje několik laboratoří ve stejném oboru a potřebují spolupracovat, tak si musí nezbytně vyměňovat a vzájemně srovnávat své počítačové výsledky. Rychlý způsob jak vyřešit tento problém je sjednotit souborové formáty nebo nainstalovat takové softwarové systémy, které jsou datově kompatibilní. Lepším řešením je samozřejmě používat pouze jeden společný systém. Článek popisuje architekturu nového klient-server systému, který nabízí možnost efektivní spolupráce laboratoří pracujících na výzkumu v oblasti studia prostorového uspořádání lidského genomu. Návrh systému je však určen především principy optické mikroskopie a je ho proto možné snadno upravit i pro jiné aplikace a prostředí. Nejpalčivějším problémem při návrhu systému bylo jak sdílet a zpracovávat objemná 3D obrazová data v klient-server architektuře.

Návaznosti

GP204/03/D034, projekt VaV
Název: Trojrozměrná analýza buněčných jader s využitím obrazové cytometrie
Investor: Grantová agentura ČR, Trojrozměrná analýza buněčných jader s využitím obrazové cytometrie
MSM 143300002, záměr
Název: Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii