Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity
proteins

D 2004

Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins

ŠMAJS, David a Magda JANALÍKOVÁ

Základní údaje

Originální název

Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins

Název česky

Hybridní koliciny U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny

Název anglicky

Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins

Autoři

ŠMAJS, David a Magda JANALÍKOVÁ

Vydání

Brno, VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků, Masarykova univerzita v Brně, 2004. od s. 11-12, 2 s. 2004

Nakladatel

Masarykova univerzita v Brně

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14110/04:00012096

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

ISBN

80-210-3321-5

Klíčová slova anglicky

colicin; immunity protein

Štítky

colicin, immunity protein

Změněno: 30. 5. 2005 14:05, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.

Anotace

ORIG EN

V originále

Přes sekvenční podobnost kolicinů U a Y nejsou producenti kolicinů U a Y zkříženě imunní. Pro studium protein-proteinových interakcí mezi kolicinem a jeho imunitním proteinem jsme zkonstruovali sedm hybridních genů pro kolicin U/Y. Plazmidy nesoucí tyto geny byly transformovány do E. coli a z těchto buněk byly následně izolovány hybridní koliciny. Zkoumali jsme jejich letální účinek na buňky transformované plazmidem nesoucí gen pro imunitní protein kolicinu U a kolicinu Y. Buňky bez imunitního proteinu sloužily jako kontrola. Zjistili jsme, že aminokyselinové zbytky kolicinů U a Y, důležité pro interakci s jejich imunitními proteiny, jsou rozdílné. Pro interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem je klíčový aminokyselinový zbytek G580. Navíc v rekognici imunitního proteinu kolicinem U hraje významnou roli aminokyselinový zbytek F576. Třetí interakční místo je distálně od Spe I místa kolicinového genu (v 34 aminokyselinách na C-konci - z nichž je u kolicinu U a Y 12 rozdílných). Oproti tomu u kolicinu Y jsou pro tutéž interakci významné aminokyselinové zbytky V590 a Y586. Menší význam pro interakci kolicinu Y s imunitním proteinem má také aminokyselinový zbytek A594 a/nebo A595. I zde se předpokládá vliv interakčního místa v C-terminálních 34 aminokyselinách.

Anglicky

Interaction of colicins with their cognate immunity proteins has been studied. Amino acid residues V590 a Y586 were found to be important for interaction of colicin Y with its cognate immunity protein and G580 and F576 in the colicin U molecule.

Návaznosti

GA310/03/1091, projekt VaV

Název: Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem

Investor: Grantová agentura ČR, Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem

Citovat

ŠMAJS, David a Magda JANALÍKOVÁ. Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins. In VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků, Masarykova univerzita v Brně, 2004. Brno: Masarykova univerzita v Brně, 2004, s. 11-12. ISBN 80-210-3321-5.

@inproceedings{571689,
   author = {Šmajs, David and Janalíková, Magda},
   address = {Brno},
   booktitle = {VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků, Masarykova univerzita v Brně, 2004.},
   keywords = {colicin; immunity protein},
   language = {cze},
   location = {Brno},
   isbn = {80-210-3321-5},
   pages = {11-12},
   publisher = {Masarykova univerzita v Brně},
   title = {Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins},
   year = {2004}
}

TY  - CONF
ID  - 571689
AU  - Šmajs, David - Janalíková, Magda
PY  - 2004
TI  - Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins
PB  - Masarykova univerzita v Brně
CY  - Brno
SN  - 8021033215
KW  - colicin
KW  - immunity protein
N2  - Přes sekvenční podobnost kolicinů U a Y nejsou producenti kolicinů U a Y zkříženě imunní. Pro studium protein-proteinových interakcí mezi kolicinem a jeho imunitním proteinem jsme zkonstruovali sedm hybridních genů pro kolicin U/Y. Plazmidy nesoucí tyto geny byly transformovány do E. coli a z těchto buněk byly následně izolovány hybridní koliciny. Zkoumali jsme jejich letální účinek na buňky transformované plazmidem nesoucí gen pro imunitní protein kolicinu U a kolicinu Y. Buňky bez imunitního proteinu sloužily jako kontrola. Zjistili jsme, že aminokyselinové zbytky kolicinů U a Y, důležité pro interakci s jejich imunitními proteiny, jsou rozdílné. Pro interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem je klíčový aminokyselinový zbytek G580. Navíc v rekognici imunitního proteinu kolicinem U hraje významnou roli aminokyselinový zbytek F576. Třetí interakční místo je distálně od Spe I místa kolicinového genu (v 34 aminokyselinách na C-konci - z nichž je u kolicinu U a Y 12 rozdílných). Oproti tomu u kolicinu Y jsou pro tutéž interakci významné aminokyselinové zbytky V590 a Y586. Menší význam pro interakci kolicinu Y s imunitním proteinem má také aminokyselinový zbytek A594 a/nebo A595. I zde se předpokládá vliv interakčního místa v C-terminálních 34 aminokyselinách.
ER  -

ŠMAJS, David a Magda JANALÍKOVÁ. Hybrid colicins U/Y and their interaction with cognate immunity proteins. In \textit{VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků, Masarykova univerzita v Brně, 2004.}. Brno: Masarykova univerzita v Brně, 2004, s.~11-12. ISBN~80-210-3321-5.

Přehled o publikaci