KOSINA, Aleš, Martin ČERNOHORSKÝ a Zdeněk KŘÍŽ. Parallelization of the Programme CICADA. In 14th Summer School on Computing Techuniques in Physics: Cluster for Computing in Physics. Praha: Fyzikální ústav AVČR, 2004, s. 26-28.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Parallelization of the Programme CICADA
Název česky Paralelizace programu CICADA
Autoři KOSINA, Aleš (203 Česká republika, garant), Martin ČERNOHORSKÝ (203 Česká republika) a Zdeněk KŘÍŽ (203 Česká republika).
Vydání Praha, 14th Summer School on Computing Techuniques in Physics: Cluster for Computing in Physics, s. 26-28, 2004.
Nakladatel Fyzikální ústav AVČR
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV RIV/00216224:14310/04:00021378
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova anglicky Parallelization; Single Coordinate Driving; Conformational Analysis; Grid
Štítky conformational analysis, GRID, Parallelization, Single Coordinate Driving
Změnil Změnil: Mgr. Zdeněk Kříž, Ph.D., učo 2703. Změněno: 22. 2. 2006 14:14.
Anotace
CICADA programme is based on SCD (Single Coordinate Driving) approach and is used for comformational analysis and molecular docing of small and middle sized molecules. CICADA programme was parallelized in Master-Slave approach. Results shows very good scalability even on small molecules with few rotable bonds. Programme can solve larger problems than its sequential predecessor.
Anotace česky
Program CICADA je postaven na SCD (Single Coordinate Driving) přístupu a je používán pro konformační analýzu malých a středních molekula a pro molekulární docking. Program CICADA byl paralelizován pomocí Master-Slave přístupu. Výsledky ukazují velmi dobrou škálovatelnost i na malých molekulách a několika málo rotovatelnými torzemi. Program může řešit ulohy většího rozsahu než dokázala sekvenční verze.
Návaznosti
MSM 143100005, záměrNázev: Strukturně-funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Strukturně-funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu
VytisknoutZobrazeno: 26. 4. 2024 10:47