RHODES, Maria, Kamila REBLOVA, Walter NILS a Jiri SPONER. Trapped water molecules are essential to structural dynamics and function of a ribozyme. The Proceedings of the National Academy of Sciences, USA: National Academy of Sciences of the USA, 2006, roč. 103, č. 36, s. 13380-13385. ISSN 1091-6490.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Trapped water molecules are essential to structural dynamics and function of a ribozyme
Název česky Zachycené molekuly vod jsou esenciální pro strukturní dynamiku a funkci ribozymů
Autoři RHODES, Maria (840 Spojené státy), Kamila REBLOVA (203 Česká republika), Walter NILS (840 Spojené státy) a Jiri SPONER (203 Česká republika, garant).
Vydání The Proceedings of the National Academy of Sciences, USA, National Academy of Sciences of the USA, 2006, 1091-6490.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10610 Biophysics
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV RIV/00216224:14310/06:00017097
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
UT WoS 000240512700024
Klíčová slova anglicky coupled molecular motions; hairpin ribozyme; molecular dynamics; proton wire
Štítky coupled molecular motions, hairpin ribozyme, molecular dynamics, proton wire
Změnil Změnila: Mgr. Kamila Réblová, Ph.D., učo 11846. Změněno: 4. 9. 2006 08:27.
Anotace
Combining explicit-solvent molecular dynamics simulation and single molecule fluorescence spectroscopy approaches, we find that a ribozyme from a subviral plant pathogen exhibits a coupled hydrogen bonding network that communicates dynamic structural rearrangements throughout the catalytic core in response to site-specific chemical modification. Trapped long-residency water molecules are critical for this network.
Anotace česky
Kombináciou explicit-solvent molekulovej dynamiky a single-molecule fluorescenčnej spektroskopie, sme našli, že ribozyme zo subvirálneho rastinného patogénu vykazuje zpriahnutú sieť vodíkových vazieb ktoré prenášajú dynamické štrukturálne zmeny naprieč katalytickým centrom ako odozva miestne-riadenej chemickej modifikácie. Zachytené molekuly vody su rozhodujúce pre túto sieť.
Návaznosti
MSM0021622413, záměrNázev: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Výzkumné záměry
VytisknoutZobrazeno: 29. 10. 2020 16:04