2006
Trapped water molecules are essential to structural dynamics and function of a ribozyme
RHODES, Maria; Kamila REBLOVA; Walter NILS a Jiri SPONERZákladní údaje
Originální název
Trapped water molecules are essential to structural dynamics and function of a ribozyme
Název česky
Zachycené molekuly vod jsou esenciální pro strukturní dynamiku a funkci ribozymů
Autoři
Vydání
The Proceedings of the National Academy of Sciences, USA, National Academy of Sciences of the USA, 2006, 1091-6490
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
10610 Biophysics
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Označené pro přenos do RIV
Ano
Kód RIV
RIV/00216224:14310/06:00017097
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
UT WoS
Klíčová slova anglicky
coupled molecular motions; hairpin ribozyme; molecular dynamics; proton wire
Změněno: 4. 9. 2006 08:27, Mgr. Kamila Réblová, Ph.D.
V originále
Combining explicit-solvent molecular dynamics simulation and single molecule fluorescence spectroscopy approaches, we find that a ribozyme from a subviral plant pathogen exhibits a coupled hydrogen bonding network that communicates dynamic structural rearrangements throughout the catalytic core in response to site-specific chemical modification. Trapped long-residency water molecules are critical for this network.
Česky
Kombináciou explicit-solvent molekulovej dynamiky a single-molecule fluorescenčnej spektroskopie, sme našli, že ribozyme zo subvirálneho rastinného patogénu vykazuje zpriahnutú sieť vodíkových vazieb ktoré prenášajú dynamické štrukturálne zmeny naprieč katalytickým centrom ako odozva miestne-riadenej chemickej modifikácie. Zachytené molekuly vody su rozhodujúce pre túto sieť.
Návaznosti
| MSM0021622413, záměr |
|