2006
The Identification of Catalytic Pentad in the Haloalkane Dehalogenase DhmA from Mycobacterium avium N85: Reaction Mechanism and Molecular Evolution
PAVLOVÁ, Martina; Martin KLVAŇA; Andrea JESENSKÁ; Zbyněk PROKOP; Hana KONEČNÁ et. al.Základní údaje
Originální název
The Identification of Catalytic Pentad in the Haloalkane Dehalogenase DhmA from Mycobacterium avium N85: Reaction Mechanism and Molecular Evolution
Název česky
Identifikace katalytických pentád v haloalkán dehalogenáze DhmA y bakterie Mycobacterium avium N85:reakční mechanismus a molekulární evoluce.
Autoři
PAVLOVÁ, Martina; Martin KLVAŇA; Andrea JESENSKÁ; Zbyněk PROKOP; Hana KONEČNÁ; T. SATO; M. TSUDA; Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ
Vydání
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY, 2006, 1047-8477
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele
Spojené státy
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Impakt faktor
Impact factor: 3.496
Kód RIV
RIV/00216224:14310/06:00017450
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
UT WoS
000243951800010
Klíčová slova anglicky
Haloalkane dehalogenase DhmA; Mycobacterium avium N85; expression ; Site-directed mutagenesis
Příznaky
Recenzováno
Změněno: 19. 3. 2010 12:17, prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
V originále
Haloalkane dehalogenase DhmA from Mycobacterium avium N85 showed poor expression and low stability when produced in Escherichia coli. Here we present expression DhmA in newly constructed pK4RP rhodococcal expression system in a soluble and stable form. Site-directed mutagenesis was used for the identification of a catalytic pentad, which makes up the reaction machinery of all currently known haloalkane dehalogenases. The putative catalytic triad Asp123, His279, Asp250 and the first halide-stabilizing residue Trp124 were deduced from sequence comparisons. The second stabilizing residue Trp164 was predicted from a homology model. Five point mutants in the catalytic pentad were constructed, tested for activity and were found inactive. A two-step reaction mechanism was proposed for DhmA. Evolution of different types of catalytic pentads and molecular adaptation towards the synthetic substrate 1,2-dichloroethane within the protein family is discussed.
Česky
Haloalkán dehalogenáza DhmA z bakterie Mycobacterium avium N85 vykazovala nizkou stabilitu a spatnou expresi, kdyz byla vložena do Escherichia coli. v článku je prezentována exprese DhmA v nově konstruovaný rhodokokální expresní systém pK4RP,který byl stabilní........
Návaznosti
| MSM0021622412, záměr |
| ||
| MSM0021622413, záměr |
|