FLASAROVÁ, Magdalena, Petra MATĚJKOVÁ, David ŠMAJS a Vladana WOZNICOVÁ. Molekulárně-biologická diagnostika spirochety Treponema pallidum v biologickém materiálu. In X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků. Brno: Masarykova univerzita v Brně, 2006, s. 7. ISBN 80-210-3942-6.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Molekulárně-biologická diagnostika spirochety Treponema pallidum v biologickém materiálu.
Název česky Molekulárně-biologická diagnostika spirochety Treponema pallidum v biologickém materiálu.
Název anglicky Molecular detection and subtyping of Treponema pallidum subsp. pallidum in clinical specimens
Autoři FLASAROVÁ, Magdalena (203 Česká republika), Petra MATĚJKOVÁ (203 Česká republika), David ŠMAJS (203 Česká republika, garant) a Vladana WOZNICOVÁ (203 Česká republika).
Vydání Brno, X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků. s. 7-7, 2006.
Nakladatel Masarykova univerzita v Brně
Další údaje
Originální jazyk čeština
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV RIV/00216224:14110/06:00016052
Organizační jednotka Lékařská fakulta
ISBN 80-210-3942-6
Klíčová slova anglicky Treponema pallidum subsp. pallidum; detection in clinical specimens; molecular typing; mucocutaneous swabs.
Štítky detection in clinical specimens, molecular typing, mucocutaneous swabs., Treponema pallidum subsp. pallidum
Změnil Změnil: prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D., učo 1116. Změněno: 6. 12. 2006 13:04.
Anotace
Prováděli jsme izolaci a detekci treponemální DNA (mikroorganismu Treponema pallidum subsp. pallidum) z různých klinických materiálů. Získaný biologický materiál jsme vyšetřili u pacientů s podezřením na syfilis, a to ve stádiu primárním, sekundárním, časně latentním a pozdně latentním včetně kongenitální syfilis. Klinické vzorky zahrnovaly kožní a slizniční stěry, séra, krevní sraženiny, likvory a tkáně. Celkem jsme vyšetřili 179 klinických vzorků, z toho 141 sér, 26 stěrů, 10 krevních sraženin, 1 likvor a 1 tkáň. Z tohoto výčtu vzorků jsme nalezli 7 pozitivních stěrů od 4 pacientů ve stádiu primární a sekundární syfilis. Dále jsme u novorozence s kongenitální syfilis prokázali tyto pozitivní vzorky: 1 likvor, 1 sérum a 1 stěr. U všech vyšetřovaných vzorků jsme provedli detekci treponemální DNA pomocí dvoukrokové (nested) PCR (polymerázové řetězové reakce) na gen tmpC (TP0319, kódující membránový lipoprotein). PCR produkty (z genu TP0319) o velikosti 451 bp jsme štěpili pomocí 3 restriktáz, Sac I, Nhe I, Dde I, k odlišení jednotlivých kmenů Treponema pallidum. Pro přesnou kmenovou typizaci jsme amplifikovali geny TP0548, TP0136, TP0319 a vzniklé PCR produkty sekvenovali.Výsledky sekvenací ve dvou případech ukázaly výskyt kmene sekvenčně totožného s kmenem SS14 a v dalších dvou případech jsme nalezli sekvenční změny v lokusech TP0548 a TP0136, které prokázaly výskyt unikátních syfilitických kmenů, doposud nepopsaných u Treponema pallidum subsp. pallidum. U jednoho vyšetřovaného novorozence jsme porovnali počet molekul DNA ve 2 různých biologických materiálech (v séru a v likvoru).
Anotace anglicky
A nested PCR amplification protocol detecting tmpC gene (TP0319, encoding putative membrane lipoprotein) was used for detection of Treponema pallidum subsp. pallidum in the clinical material. We tested 138 samples of blood sera of 111 adult patients in primary, secondary, early and late latent stages of the infection as well as of patients suspected of syphilis. T. p. pallidum DNA was not detected in any of the analyzed sera samples. Out of 11 mucocutaneous swabs (7 genital and 4 pharyngeal ones), 6 from 3 patients with primary or secondary syphilis were positive. In addition, one skin swab was positive in patient with early congenital syphilis. Sera and cerebrospinal fluid samples from this patient were also positive. DNA sequencing of genes TP0136 and TP0548 in the positive samples revealed two patients with DNA sequence identical to T. p. pallidum strain SS14 and two unique, not yet known T. p. pallidum strains. The advances in molecular typing of T. p. pallidum in clinical material will become important for epidemiologic consequences and for clinical discrimination between reinfection and reactivation of the syphilitic process.
Návaznosti
GA310/04/0021, projekt VaVNázev: Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum
MSM0021622415, záměrNázev: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NR8967, projekt VaVNázev: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
VytisknoutZobrazeno: 19. 9. 2024 05:21