D 2007

Genetické rozdíly mezi původci yaws a syfilis.

STROUHAL, Michal; David ŠMAJS a Petra MATĚJKOVÁ

Základní údaje

Originální název

Genetické rozdíly mezi původci yaws a syfilis.

Název česky

Genetické rozdíly mezi původci yaws a syfilis.

Název anglicky

Genetic differences between causative agents of yaws and syfilis.

Autoři

STROUHAL, Michal; David ŠMAJS a Petra MATĚJKOVÁ

Vydání

Brno, XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků, od s. 13-14, 2 s. 2007

Nakladatel

Masarykova univerzita v Brně

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ne

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

ISBN

978-80-210-4234-6

Klíčová slova anglicky

Genetic differences; yaws; syfilis
Změněno: 30. 6. 2008 11:31, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.

Anotace

V originále

Rod Treponema zahrnuje několik patogenních spirochet: T. pallidum ssp. pallidum (TPA) je původcem sexuálně přenosného onemocnění syfilis, T. pallidum ssp. pertenue (TPE) vyvolává endemické nevenerální treponemální infekce a T. paraluiscuniculi (TPAR) způsobuje venerickou spirochetózu králíků a není patogenní pro člověka. V této studii byly porovnány genomy blízce příbuzných treponemálních kmenů Nichols (TPA), SS14 (TPA), Samoa D (TPE) a Cuniculi A (TPAR) pomocí metody whole genome fingerprinting (WGF) a komparativního genomového sekvenování (CGS). U WGF byly genomy studovaných kmenů rozděleny do 97 překrývajících se intervalů, tyto intervaly byly amplifikovány a štěpeny restrikčními enzymy BamH I, EcoR I a Hind III. Jednotlivé restrikční profily byly použity k identifikaci heterologních oblastí. CGS byla založená na hybridizaci testované genomové DNA kmenů SS14, Samoa D a Cuniculi A k referenční genomové DNA kmene Nichols na oligonukleotidovém čipu. Byly získány kompletní nukleotidové sekvence kmenů SS14 (TPA) a Samoa D (TPE). Sekvenční rozdíly mezi genomy blízce příbuzných treponem zjištěné metodami WGF a CGS byly použity pro definování poddruhové variability T. pallidum a vytipování kandidátních úseků pro screening klinických izolátů.

Anglicky

Genetic differences between causative agents of yaws and syfilis were determined, described and analyzed.

Návaznosti

GA310/07/0321, projekt VaV
Název: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NR8967, projekt VaV
Název: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů