New approaches to automated cell image acquisition and analysis using fluorescence microscopy

VAŘECHA, Miroslav, Pavel MATULA a Michal KOZUBEK. New approaches to automated cell image acquisition and analysis using fluorescence microscopy. In XIX. Biologické Dny - International Symposium "The Functional Organization of the Cell Nucleus". 2008. ISBN 978-80-7399-545-4.

Základní údaje

• Originální název: New approaches to automated cell image acquisition and analysis using fluorescence microscopy
• Název česky: Nové přístupy k automatizovanému snímání a analýze buněk pomocí fluorescenční mikroskopie
• Autoři: VAŘECHA, Miroslav (203 Česká republika, garant), Pavel MATULA (203 Česká republika) a Michal KOZUBEK (203 Česká republika).
• Vydání: XIX. Biologické Dny - International Symposium "The Functional Organization of the Cell Nucleus" 2008.

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Vyžádané přednášky
• Obor: 20200 2.2 Electrical engineering, Electronic engineering, Information engineering
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14330/08:00026665
• Organizační jednotka: Fakulta informatiky
• ISBN: 978-80-7399-545-4
• Klíčová slova anglicky: live-cell imaging;fluorescence microscopy;image analysis
• Štítky: fluorescence microscopy, Image analysis, live-cell imaging
• Příznaky: Mezinárodní význam, Recenzováno

Anotace

Fluorescence microscopy has become the leading technology to study structure as well as dynamics of cellular components. The studies can be performed in three-dimensional (3D) spatial coordinate system as well as in time and spectral dimensions. For example, in cell nucleus studies, fluorescence microscopy enables to observe not only 3D chromatin structure (especially spatial organization of selected genes or chromosomes) but also its dynamics in space (time-lapse imaging of fluorescence-labeled histones within cell nucleus). At the Centre for Biomedical Image Analysis of Masaryk University in Brno, we have been developing special systems for automated cell image acquisition and analysis using fluorescence microscopy. We have called them high-resolution image cytometers (HRCMs) in literature. The presentation will focus on the latest developments in HRCM technology. Besides microscopy hardware and software, also examples of possible applications will be presented.

Anotace česky

Nové přístupy k automatizovanému snímání a analýze buněk pomocí fluorescenční mikroskopie.

Návaznosti

• LC535, projekt VaV: Název: Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii

• MSM0021622419, záměr: Název: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy

• 2B06052, projekt VaV: Název: Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů (Akronym: Biomarker)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů