J 2008

Surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight proteomic profiling of breast carcinomas identifies clinicopathologically relevant groups of patients similar to previously defined clusters from cDNA expression

BROŽKOVÁ, Kristýna; Eva BUDINSKÁ; Pavel BOUCHAL; Lenka HERNYCHOVÁ; Dana KNOFLÍČKOVÁ et. al.

Základní údaje

Originální název

Surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight proteomic profiling of breast carcinomas identifies clinicopathologically relevant groups of patients similar to previously defined clusters from cDNA expression

Název česky

Proteinové profilování karcinomů prsu metodou SELDI-TOF MS odhaluje klinickopatologicky relevantní skupiny pacientů stejně jako dříve definované klastry na základě exprese cDNA

Autoři

BROŽKOVÁ, Kristýna (203 Česká republika, domácí); Eva BUDINSKÁ (703 Slovensko, domácí); Pavel BOUCHAL (203 Česká republika, domácí); Lenka HERNYCHOVÁ (203 Česká republika); Dana KNOFLÍČKOVÁ (203 Česká republika); Dalibor VALÍK (203 Česká republika, domácí); Rostislav VYZULA (203 Česká republika, domácí); Bořivoj VOJTĚŠEK (203 Česká republika) a Rudolf NENUTIL (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

Breast Cancer Research, London, Great Britain, Biomed Central Ltd. 2008, 1465-5411

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

30200 3.2 Clinical medicine

Stát vydavatele

Velká Británie a Severní Irsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 5.052

Kód RIV

RIV/00216224:14310/08:00028249

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000257869600016

Klíčová slova anglicky

breast cancer; SELDI-TOF MS; cDNA clusters

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 1. 2. 2012 09:55, doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.

Anotace

V originále

Microarray-based gene expression profiling represents a major breakthrough for understanding the molecular complexity of breast cancer. cDNA expression profiles cannot detect changes in activities that arise from posttranslational modifications, however, and therefore do not provide a complete picture of all biologically important changes that occur in tumors. Additional opportunities to identify and/or validate molecular signatures of breast carcinomas are provided by proteomic approaches. Surface-enhanced laser desorption/ ionization time-of-flight mass spectrometry (SELDI-TOF MS) offers high-throughput protein profiling, leading to extraction of protein array data, calling for effective and appropriate use of bioinformatics and statistical tools.

Česky

Genomové profilování na principu cDNA-microarrays reprezentuje základní nástroj pro pochopení molekulární komplexity rakoviny prsu. cDNA expresní profily nicméně nejsou schopny detekovat změny dané posttranslačními modifikacemi proteinů a neposkytují tedy komplexní obraz všech biologicky významných změn, které nastávají v nádorech. Nové možnosti identifikace a/nebo validace molekulárních změn u karcinomu prstu proto představují proteomické přístupy. Metoda SELDI-TOF MS umožňuje vysoce kapacitní proteinové profilování a poskytuje data "array" typu snadno analyzovatelná pomocí bioinformatických a statistických nástrojů.

Návaznosti

MZ0MOU2005, záměr
Název: Funkční diagnostika zhoubných nádorů
NR8338, projekt VaV
Název: Funkční analýza drah regulovaných proteinem p53 u nádorů prsu: Integrace genomických a proteomických přístupů zahrnujících techniky DNA-macroarray a hmotnostní spektrometrii na principu SELDI-TOF