Generation of Specific Antibodies Against Plant Telomere Binding Proteins

PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ, Petra a Jiří FAJKUS. Generation of Specific Antibodies Against Plant Telomere Binding Proteins. In Protein Expression Europe & Antibodies Europe. 2008.

Základní údaje

• Originální název: Generation of Specific Antibodies Against Plant Telomere Binding Proteins
• Název česky: Vývoj specifických protilátek proti rostlinným telomer-vazebným proteinům.
• Autoři: PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ, Petra (203 Česká republika, garant) a Jiří FAJKUS (203 Česká republika).
• Vydání: Protein Expression Europe & Antibodies Europe, 2008.

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Konferenční abstrakt
• Obor: Genetika a molekulární biologie
• Stát vydavatele: Spojené státy
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14310/08:00025187
• Organizační jednotka: Přírodovědecká fakulta
• Klíčová slova anglicky: antibody; AtTRB proteins; plant
• Štítky: antibody, AtTRB proteins, plant
• Příznaky: Mezinárodní význam

Anotace

AtTRB (Telomeric Repeat Binding) proteins bind plant telomeric sequence (TTTAGGG)n via their Myb domain, similarly to human hTRF1 or hTRF2 (Telomeric Repeat Factor) which bind to human telomeric sequence (TTAGGG)n. In A. thaliana there are five AtTRB homologues. All AtTRBs contain Myb domain at the N-terminus, central H1/5-like domain and coiled-coil domain at the C-terminus. Even though they are similar at AA sequence they partly differ in their chemical properties or in expression levels in different plant compartments. To determine more precisely the binding sequence of AtTRB proteins and their intracellular localization in vivo we need to get specific antibodies for ChIP experiments. We have expressed the least similar peptide sequence of each AtTRB protein that is located in the loop between Myb domain and H1/5 domain in E. coli.

Anotace česky

AtTRB proteiny se vážící se na telomerickou DNA skrz jeich Myb vazebnou doménu, stejně jako lidské hTRF1 a hTRF2. V A. thaliana bylo objeveno 5 homologů AtTRB proteinů. Všechny obsahují C-koncovou Myb doménu a centrální H1/5-like doménu. Vzhledem k vysoké podobnosti všech pěti proteinů bylo nutno při návrhu specifických protilátek vytipovat nejméně homologní oblast. Tato oblast lokalizovaná mezi Myb doménou a h1/5 doménou, byla naklonována do expresních vektorů a exprimována v bakteriálním expresním systému. Takto exprimovanými proteiny byly imunizovány myši, které vytváření monoklonální protilátky, specificky rozeznávající jednotlivé AtTRB proteiny.

Návaznosti

• GP521/08/P452, projekt VaV: Název: Charakterizace a funkční diverzita proteinů rodiny SMH, která je specifická pro rostliny

Investor: Grantová agentura ČR, Charakterizace a funkční diverzita proteinů rodiny SMH, která je specifická pro rostliny

• MSM0021622415, záměr: Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací