Treponema pallidum ssp. pallidum a její detekce v klinickém materiálu.

FLASAROVÁ, Magdalena, Petra MATĚJKOVÁ, Zuzana VALIŠOVÁ, David ŠMAJS a Vladana WOZNICOVÁ. Treponema pallidum ssp. pallidum a její detekce v klinickém materiálu. In Celostátní sjezd mikrobiologie a epidemiologie, sborník abstrakt. 2008.

Základní údaje

• Originální název: Treponema pallidum ssp. pallidum a její detekce v klinickém materiálu.
• Název česky: Treponema pallidum ssp. pallidum a její detekce v klinickém materiálu.
• Název anglicky: Detection of Treponema pallidum in clinical material
• Autoři: FLASAROVÁ, Magdalena (203 Česká republika), Petra MATĚJKOVÁ (203 Česká republika), Zuzana VALIŠOVÁ (203 Česká republika), David ŠMAJS (203 Česká republika, garant) a Vladana WOZNICOVÁ (203 Česká republika).
• Vydání: Celostátní sjezd mikrobiologie a epidemiologie, sborník abstrakt, 2008.

Další údaje

• Originální jazyk: čeština
• Typ výsledku: Konferenční abstrakt
• Obor: 10600 1.6 Biological sciences
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14110/08:00025298
• Organizační jednotka: Lékařská fakulta
• Klíčová slova česky: syfilis; Treponema pallidum ssp. pallidum; klinická diagnostika
• Klíčová slova anglicky: syphilis; Treponema pallidum ssp. pallidum; clinical diagnostics
• Štítky: clinical diagnostics, syphilis, Treponema pallidum ssp. pallidum

Anotace

Metodou nested PCR detekující gen tmpC a polA bylo celkem nalezeno 40 pozitivních vzorků od 27 pacientů včetně 2 novorozenců. Ze 73 vyšetřovaných stěrů bylo nalezeno 22 pozitivních stěrů od 16 pacientů a z 46 vzorků plné krve bylo pozitivních 16 od 15 pacientů. Z toho u 2 novorozenců s kongenitální syfilis byly nalezeny čtyři PCR pozitivní klinické vzorky. U jednoho dítěte byla prokázána PCR pozitivita u plné krve a u druhého byly zachyceny 3 pozitivní klinické izoláty ze séra, stěru a likvoru. U 22 z 40 pozitivních vzorků byla úspěšná typizace alespoň v 1 z lokusů TP136 nebo TP548 a bylo tak získáno 6 vzorků sekvenčně unikátních a 16 vzorků shodných s popsaným kmenem SS14. V případě typizování více vzorků od téhož pacienta byly nalezeny shodné výsledky.

Anotace anglicky

Nested PCR detecting tmpC and polA genes was employed to discover 40 PCR positive samples from 27 patients including 2 newborns. Out of total 73 lesion swabs, 22 was PCR positive (coming from 16 patients). Among 46 whole blood samples, 16 were PCR positive (from 15 patients). 4 samples were PCR positive in 2 newborns with congenital syphilis. One newborn was PCR positive in the sample of whole blood and the second one was PCR positive in serum, lesion swab and cerebrospinal fluid. In 22 out of 40 samples containing treponemal DNA, typing of at least one of two loci (TP0136 or TP0548) was succesful and 6 unique sequences were discovered. Remaining 16 samples showed sequences identical to SS14 strain. There was complete concordance of multiple samples collected from the same patient where applicable.

Návaznosti

• GA310/07/0321, projekt VaV: Název: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum

Investor: Grantová agentura ČR, Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum

• MSM0021622415, záměr: Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

• NR8967, projekt VaV: Název: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů

Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů