Odběr a zpracování vzorků pro expresní DNA čipy

TICHÝ, Boris, M. SVOBODA, Jiří MAYER and Šárka POSPÍŠILOVÁ. Odběr a zpracování vzorků pro expresní DNA čipy (Sample taking and processing for expression DNA microarrays). Klinická onkologie. 2006, vol. 19, suppl, p. 346-350. ISSN 1802-5307.

Basic information

• Original name: Odběr a zpracování vzorků pro expresní DNA čipy
• Name (in English): Sample taking and processing for expression DNA microarrays
• Authors: TICHÝ, Boris (203 Czech Republic, guarantor), M. SVOBODA (203 Czech Republic), Jiří MAYER (203 Czech Republic) and Šárka POSPÍŠILOVÁ (203 Czech Republic).
• Edition: Klinická onkologie, 2006, 1802-5307.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Article in a journal
• Field of Study: 30200 3.2 Clinical medicine
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14310/06:00028311
• Organization unit: Faculty of Science
• Keywords (in Czech): RNA; DNA čip; biopsie; genová exprese
• Keywords in English: RNA; microarray; biopsy; gene expression
• Tags: biopsy, GENE EXPRESSION, microarray, RNA
• Tags: Reviewed

Abstract

Moderní metodiky studia genové exprese na úrovni RNA využívající DNA čipy (DNA microarrays) představují účinný nástroj nejen pro výzkum onkologických onemocnění, ale mají i velký potenciál stát se základem nových diagnostických postupů. Jejich úspěšná aplikace však vyžaduje zvládnutí problematických postupů jako jsou odběr vzorku, izolace RNA nebo značení nukleových kyselin. S ohledem na množství různých DNA čipových platforem, neexistuje jeden univerzální návod, který by mohl být použit ve všech laboratořích. Protokoly zpracování DNA čipů se proto, nikdy velmi výrazně liší, což má negativní dopad i na možnost jejich diagnostického využití.

Abstract (in English)

Gene expression profiling using DNA microarrays represents not only a powerfull tool for oncological research but have also a big potential to become a standard diagnostic technique. However, successfull microarray application needs to overcome some pitfalls such as sample collection, RNA isolation or nucleic acid labeling. Due to the number of microarray platforms there is no universal guide that can be used by all laboratories. The number of sometimes very different protocols for DNA microarray processing has a negative impact on their diagnostic utilization.

Links

• NR8448, research and development project: Name: Charakterizace genové exprese leukemických buněk pomocí DNA čipů a její využití pro molekulární diagnostiku a predikci odpovědi na léčbu