Cloning, expression and structure determination of SH3b cell wall binding domain of bacteriophage 812 endolysin

BENEŠÍK, Martin; Jiří NOVÁČEK; Lubomír JANDA; Radka DOPITOVÁ; Lukáš ŽÍDEK; Jiří DOŠKAŘ; Vladislava RŮŽIČKOVÁ; Marek MOŠA a Roman PANTŮČEK. Cloning, expression and structure determination of SH3b cell wall binding domain of bacteriophage 812 endolysin. In Phages 2011 - Bacteriophage Applications, 19-21 September 2011, St Hilda's College, Oxford, UK. 2011.

Základní údaje

Originální název

Cloning, expression and structure determination of SH3b cell wall binding domain of bacteriophage 812 endolysin

Autoři

BENEŠÍK, Martin; Jiří NOVÁČEK; Lubomír JANDA; Radka DOPITOVÁ; Lukáš ŽÍDEK; Jiří DOŠKAŘ; Vladislava RŮŽIČKOVÁ; Marek MOŠA a Roman PANTŮČEK ORCID

Vydání

Phages 2011 - Bacteriophage Applications, 19-21 September 2011, St Hilda's College, Oxford, UK, 2011

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Velká Británie a Severní Irsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14310/11:00050057

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova anglicky

bacteriophage therapy; Staphylococcus aureus; bacteriophage endolysin; SH3b domain

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

---

Anotace

V originále

In this study we focused on endolysin of staphylococcal bacteriophage 812, a member of unclassified SPO1-like viruses from family Myoviridae. The endolysin of phage 812 includes three domains: two catalytic domains and the SH3b-domain that is probably a cell wall targeting domain, which could be responsible for binding of endolysin to peptidoglycan. The gene sequence for the C-terminal SH3b domain was cloned in pET28 vector and expressed as a soluble protein in E. coli BL21 (DE3) to determine the 3D structure of the protein. A native variant of the SH3b protein was purified without the his-tag. Subsequently, three variants of this protein have been prepared: (i) non-labeled, (ii) single-labeled (15N) and (iii) double-labeled (13C, 15N) domain. The protein was purified to homogeneity using ammonium sulphate precipitation, anion exchange chromatography, cation exchange chromatography, and gel filtration. Functionality of the cell wall binding of the purified protein has been verified by a co-sedimentation test in using S. aureus peptidoglycan.

---

Návaznosti

GAP206/11/0758, projekt VaV	Název: Vývoj metodologie s vysokým rozlišením pro NMR studie neuspořádaných proteinů s vysoce degenerovanými rezonančními frekvencemi (Akronym: HIGHRES) Investor: Grantová agentura ČR, Vývoj metodologie s vysokým rozlišením pro NMR studie neuspořádaných proteinů s vysoce degenerovanými rezonančními frekvencemi
GA310/09/0459, projekt VaV	Název: Úloha bakteriofágů v horizontálním přenosu genů virulence a rezistence u Staphylococcus aureus Investor: Grantová agentura ČR, Úloha bakteriofágů v horizontálním přenosu genů virulence a rezistence u Staphylococcus aureus
GP204/02/D099, projekt VaV	Název: Knihovna ribotypizačních profilů typových kultur bakterií Investor: Grantová agentura ČR, Knihovna ribotypizačních profilů typových kultur bakterií
MSM0021622415, záměr	Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
TA01010405, projekt VaV	Název: Výzkum stafylokokových bakteriofágových mutant s širokým spektrem hostitelů (Akronym: TAČR/IMUNA-1) Investor: Technologická agentura ČR, Výzkum stafylokokových bakteriofágových mutant s širokým spektrem hostitelů