ČEJKOVÁ, Darina, Marie ZOBANÍKOVÁ, Lei CHEN, Petra POSPÍŠILOVÁ, Michal STROUHAL, Xiang QIN, Lenka MIKALOVÁ, Stephen J. NORRIS, Donna M. MUZNY, Richard A. GIBBS, Lucinda L. FULTON, Erica SODERGREN, George M. WEINSTOCK a David ŠMAJS. Whole Genome Sequences of Three Treponema pallidum ssp. pertenue Strains: Yaws and Syphilis Treponemes Differ in Less than 0.2% of the Genome Sequence. PLoS Neglected Tropical Diseases, San Francisco: Public Library of Science, 2012, roč. 6, č. 1, s. "nestrankovano". ISSN 1935-2727. doi:10.1371/journal.pntd.0001471.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Whole Genome Sequences of Three Treponema pallidum ssp. pertenue Strains: Yaws and Syphilis Treponemes Differ in Less than 0.2% of the Genome Sequence
Autoři ČEJKOVÁ, Darina (203 Česká republika, domácí), Marie ZOBANÍKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Lei CHEN (840 Spojené státy americké), Petra POSPÍŠILOVÁ (203 Česká republika, domácí), Michal STROUHAL (203 Česká republika, domácí), Xiang QIN (840 Spojené státy americké), Lenka MIKALOVÁ (203 Česká republika, domácí), Stephen J. NORRIS (840 Spojené státy americké), Donna M. MUZNY (840 Spojené státy americké), Richard A. GIBBS (840 Spojené státy americké), Lucinda L. FULTON (840 Spojené státy americké), Erica SODERGREN (840 Spojené státy americké), George M. WEINSTOCK (840 Spojené státy americké) a David ŠMAJS (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání PLoS Neglected Tropical Diseases, San Francisco, Public Library of Science, 2012, 1935-2727.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Spojené státy americké
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW Art.No. e1471
Impakt faktor Impact factor: 4.716 v roce 2011
Kód RIV RIV/00216224:14110/12:00081800
Organizační jednotka Lékařská fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0001471
UT WoS 000300416100021
Klíčová slova anglicky Treponema pallidum; Syphilis; Genome; Yaws
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 29. 4. 2016 10:10.
Anotace
Spirochete Treponema pallidum ssp. pertenue (TPE) is the causative agent of yaws while strains of Treponema pallidum ssp. pallidum (TPA) cause syphilis. Both yaws and syphilis are distinguished on the basis of epidemiological characteristics and clinical symptoms. Neither treponeme can reproduce outside the host organism, which precludes the use of standard molecular biology techniques used to study cultivable pathogens. In this study, we determined high quality whole genome sequences of TPE strains and compared them to known genetic information for T. pallidum ssp. pallidum strains. The genome structure was identical in all three TPE strains and also between TPA and TPE strains. The TPE genome length ranged between 1,139,330 bp and 1,139,744 bp. The overall sequence identity between TPA and TPE genomes was 99.8%, indicating that the two pathogens are extremely closely related. A set of 34 TPE genes (3.5%) encoded proteins containing six or more amino acid replacements or other major sequence changes. These genes more often belonged to the group of genes with predicted virulence and unknown functions suggesting their involvement in infection differences between yaws and syphilis.
Návaznosti
GA310/07/0321, projekt VaVNázev: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Standardní projekty
MSM0021622415, záměrNázev: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Výzkumné záměry
VytisknoutZobrazeno: 11. 12. 2019 13:08