-
Decoding Protein Stabilization: Impact on Aggregation, Solubility, and Unfolding Mechanisms J - Článek v odborném periodikuHAVLÁSEK, Martin; Sérgio Manuel MARQUES; Veronika SZOTKOWSKÁ; Antonín KUNKA; Petra BABKOVÁ; Jiří DAMBORSKÝ; Zbyněk PROKOP a David BEDNÁŘ. Decoding Protein Stabilization: Impact on Aggregation, Solubility, and Unfolding Mechanisms. Journal of Chemical Information and Modeling. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2025, roč. 65, č. 16, s. 8688-8701. ISSN 1549-9596. Dostupné z: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.5c00611.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2519767/cs
-
Modulation of Amyloid-β Aggregation by Surface Proteins from Pathogens Associated with Alzheimer's Disease J - Článek v odborném periodikuKUNKA, Antonín; Hana HŘÍBKOVÁ; Tereza VÁŇOVÁ; Veronika POSPÍŠILOVÁ; Martin HAVLÁSEK; Jan HAVIERNIK; Daniel RŮŽEK; Jiří DAMBORSKÝ; Dáša BOHAČIAKOVÁ a Zbyněk PROKOP. Modulation of Amyloid-β Aggregation by Surface Proteins from Pathogens Associated with Alzheimer's Disease. ACS Chemical Neuroscience. AMER CHEMICAL SOC, 2025, roč. 16, č. 18, s. 3554-3566. ISSN 1948-7193. Dostupné z: https://doi.org/10.1021/acschemneuro.5c00444.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2519777/cs
-
AggreProt: a web server for predicting and engineering aggregation prone regions in proteins J - Článek v odborném periodikuPLANAS IGLESIAS, Joan; Simeon BORKO; Jan SWIATKOWSKI; Matej ELIAS; Martin HAVLÁSEK; Ondrej SALAMON; Ekaterina GRAKOVA; Antonín KUNKA; Tomas MARTINOVIC; Jiří DAMBORSKÝ; Jan MARTINOVIC a David BEDNÁŘ. AggreProt: a web server for predicting and engineering aggregation prone regions in proteins. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2024, roč. 52, W1, s. "W159"-"W169", 11 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/nar/gkae420.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2421847/cs
-
Upravená dehalogenáza LinB116 se zlepšenou termostabilitou G - Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek)HAVLÁSEK, Martin; Jiří DAMBORSKÝ a David BEDNÁŘ. Upravená dehalogenáza LinB116 se zlepšenou termostabilitou. 2024.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2471869/cs
-
Advancing Enzyme's Stability and Catalytic Efficiency through Synergy of Force-Field Calculations, Evolutionary Analysis, and Machine Learning J - Článek v odborném periodikuKUNKA, Antonín; Sérgio Manuel MARQUES; Martin HAVLÁSEK; Michal VAŠINA; Nikola VELÁTOVÁ; Lucia CENGELOVÁ; David KOVÁŘ; Jiří DAMBORSKÝ; Martin MAREK; David BEDNÁŘ a Zbyněk PROKOP. Advancing Enzyme's Stability and Catalytic Efficiency through Synergy of Force-Field Calculations, Evolutionary Analysis, and Machine Learning. ACS Catalysis. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2023, roč. 13, č. 19, s. 12506-12518. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://doi.org/10.1021/acscatal.3c02575.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2329981/cs
-
Computational Enzyme Stabilization Can Affect Folding Energy Landscapes and Lead to Catalytically Enhanced Domain-Swapped Dimers J - Článek v odborném periodikuMARKOVÁ, Klára; Antonín KUNKA; Klaudia CHMELOVÁ; Martin HAVLÁSEK; Petra BABKOVÁ; Sérgio Manuel MARQUES; Michal VAŠINA; Joan PLANAS IGLESIAS; Radka CHALOUPKOVÁ; David BEDNÁŘ; Zbyněk PROKOP; Jiří DAMBORSKÝ a Martin MAREK. Computational Enzyme Stabilization Can Affect Folding Energy Landscapes and Lead to Catalytically Enhanced Domain-Swapped Dimers. ACS Catalysis. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2021, roč. 11, č. 21, s. 12864-12885. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://doi.org/10.1021/acscatal.1c03343.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1831417/cs