Publication Records

NEMERGUT, Michal, Sérgio Manuel MARQUES, Lukáš UHRÍK, Tereza VÁŇOVÁ, Markéta NEZVEDOVÁ, Darshak Chandulal GADARA, Durga JHA, Jan TULIS, Veronika NOVÁKOVÁ, Joan PLANAS IGLESIAS, Antonín KUNKA, Anthony Thomas P LEGRAND, Hana HŘÍBKOVÁ, Veronika POSPÍŠILOVÁ, Jiří SEDMÍK, Jan RAŠKA, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ, Dáša BOHAČIAKOVÁ, Zdeněk SPÁČIL, Lenka HERNYCHOVÁ, David BEDNÁŘ and Martin MAREK. Domino-like effect of C112R mutation on ApoE4 aggregation and its reduction by Alzheimer’s Disease drug candidate. Molecular Neurodegeneration. England: BMC, 2023, vol. 18, No 1, p. 1-25. ISSN 1750-1326. Available from: https://dx.doi.org/10.1186/s13024-023-00620-9.

TOUL, Martin, Veronika SLONKOVÁ, Jan MIČAN, Adam Paulin URMINSKÝ, Maria TOMKOVA, Erik SEDLÁK, David BEDNÁŘ, Jiří DAMBORSKÝ, Lenka HERNYCHOVÁ and Zbyněk PROKOP. Identification, characterization, and engineering of glycosylation in thrombolytics. Biotechnology Advances. OXFORD: Elsevier, 2023, vol. 66, September 2023, p. 1-23. ISSN 0734-9750. Available from: https://dx.doi.org/10.1016/j.biotechadv.2023.108174.

FRIEDLOVÁ, Nela, Lenka DOSEDĚLOVÁ, Filip ZAVADIL KOKÁŠ, Lenka HERNYCHOVÁ, Ted HUPP, Bořivoj VOJTĚŠEK and Marta NEKULOVÁ. IFITM PROTEINS REGULATE IMMUNE-RELATED CELL SURFACE MOLECULES IN CERVICAL CARCINOMA. 2022.

FRIEDLOVÁ, Nela, Michaela GALIOVÁ VAŠINOVÁ, Kristýna BILAVČÍKOVÁ, Pavel COUFALÍK, Lenka HERNYCHOVÁ, Vlastimil TICHÝ, Ted HUPP, Bořivoj VOJTĚŠEK and Marta NEKULOVÁ. IFITM PROTEINS REGULATE SENSITIVITY OF CERVICAL CANCER CELLS TO CISPLATIN. In XXI. Interdisciplinary meeting of young life scientists. 2022. ISSN 2336-7202.

TOUL, Martin, Andrea SMITH, José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, Martin MAREK, Lenka HERNYCHOVÁ, Veronika LIŠKOVÁ, Daniel PLUSKAL, Stephane EMOND, Mark DÖRR, Joan PLANAS IGLESIAS, Radka CHALOUPKOVÁ, David BEDNÁŘ, Zbyněk PROKOP, Uwe T. BORNSCHEUER, Florian HOLLFELDER and Jiří DAMBORSKÝ. Engineering protein dynamics for the understanding of divergent evolution of the Renilla luciferase. In The 45th FEBS Congress. 2021. ISSN 2211-5463.

SCHENKMAYEROVÁ, Andrea, José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, Martin TOUL, Martin MAREK, Lenka HERNYCHOVÁ, Joan PLANAS IGLESIAS, Veronika LIŠKOVÁ, Daniel PLUSKAL, Michal VAŠINA, Stephane EMOND, Mark DÖRR, Radka CHALOUPKOVÁ, David BEDNÁŘ, Zbyněk PROKOP, Florian HOLLFELDER, Uwe T. BORNSCHEUER and Jiří DAMBORSKÝ. Engineering the protein dynamics of an ancestral luciferase. Nature Communications. London: Nature Publishing Group, 2021, vol. 12, No 1, p. 3616-3631. ISSN 2041-1723. Available from: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-021-23450-z.

FRIEDLOVÁ, Nela, Lenka DOSEDĚLOVÁ, Filip ZAVADIL KOKÁŠ, Lenka HERNYCHOVÁ, Bořivoj VOJTĚŠEK and Marta NEKULOVÁ. Vliv IFITM1 na „surfaceom“ buněk cervikálního karcinomu. In Brněnské onkologické dny. 2021. ISSN 0862-495X.

NÁLEŽINSKÁ, Monika, DUBSKÁ L ZDRAŽILOVÁ, Dalibor VALÍK, Lenka HERNYCHOVÁ, T PAVLÍK, M MAZALOVÁ, Josef CHOVANEC and Vuk FAIT. Úskalí laboratorních metod v ovariálním skríninku - doba "-omická"? Czech Yearbook of Public & Private International Law (Vol.11) - 2020 Read more: https://www.cyil.eu/contents-cyil-2020/. Praha: Czech Society of International Law, 2020.

SCHENKMAYEROVA, A., G. PINTO, Martin MAREK, Martin TOUL, Lenka HERNYCHOVÁ, Veronika LIŠKOVÁ, S. EMOND, David BEDNÁŘ, Zbyněk PROKOP, Radka CHALOUPKOVÁ, F. HOLLFELDER and U.T. BORNSCHEUER. Functional switching based on altered enzyme flexibility via InDel mutagenesis of a reconstructed ancestor. In European Biotechnology Congress. 2019. ISSN 0168-1656. Available from: https://dx.doi.org/10.1016/j.jbiotec.2019.05.118.

CHALOUPKOVÁ, Radka, Veronika LIŠKOVÁ, Martin TOUL, Klára MARKOVÁ, Eva ŠEBESTOVÁ, Lenka HERNYCHOVÁ, Martin MAREK, José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, Daniel PLUSKAL, Jitka WATERMAN, Zbyněk PROKOP and Jiří DAMBORSKÝ. Light-Emitting Dehalogenases: Reconstruction of Multifunctional Biocatalysts. ACS Catalysis. Washington, D.C.: AMER CHEMICAL SOC, 2019, vol. 9, No 6, p. 4810-4823. ISSN 2155-5435. Available from: https://dx.doi.org/10.1021/acscatal.9b01031.

PJECHOVÁ, Mariana, Lenka HERNYCHOVÁ, Peter TOMAŠEC and Bořivoj VOJTĚŠEK. Adenovírusové vektory v génovej terapii. Klinická onkologie. 2015. ISSN 0862-495X.

COUFALOVÁ, Dominika, Michal ĎURECH, Eva RŮČKOVÁ, Ted HUPP, Bořivoj VOJTĚŠEK and Lenka HERNYCHOVÁ. Analýza dynamiky oligomerizace proteinu Reptin metodou vodík/deuteriové výměny ve spojení s hmotnostní spektrometrií. 2015. ISSN 0862-495X.

ZAHRADNÍKOVÁ, Martina, Rudolf NENUTIL, Bořivoj VOJTĚŠEK, Miloš NOVOTNÝ and Lenka HERNYCHOVÁ. Glykanové profilování sér pacientek s rakovinou vaječníku senzitivních na léčbu platinovými deriváty. In Brněnské onkologické dny 2015. 2015. ISSN 0862-495X.

COUFALOVÁ, Dominika, Bořivoj VOJTĚŠEK and Lenka HERNYCHOVÁ. Srovnání programů pro analýzu dat z metody vodík/deuteriové výměny ve spojení s hmotnostníspektrometrií: HDX Workbench vs. HDExaminer. In 4. konference České společnosti pro hmotnostní spektrometrii. 2015. ISBN 978-80-905045-4-7.

PJECHOVÁ, Mariana, Lenka HERNYCHOVÁ, Peter TOMAŠEC and Bořivoj VOJTĚŠEK. Analýza fosfoproteínov a signálnych dráh kvantitatívno‑ proteomickými metódami. Klinická onkologie. 2014. ISSN 0862-495X.

ZAHRADNÍKOVÁ, Martina, Lenka HERNYCHOVÁ, Bořivoj VOJTĚŠEK and Miloš NOVOTNÝ. Nové trendy ve studiu glykosylace proteinů u onkologických onemocnění (New Trends in the Study of Protein Glycosylation in Oncological Diseases). Klinická onkologie. Ambit Media a.s., 2014, vol. 2014, 27(Supl 1), p. S121-S128, 8 pp. ISSN 0862-495X.

PJECHOVÁ, Mariana, Lenka HERNYCHOVÁ, Peter TOMAŠEC and Bořivoj VOJTĚŠEK. Quantitative proteomic approach to study of pro- inflammatory properties of replication- deficient adenovirus vectors. In 5th RECAMO Joint meeting - Through cancer research towards applied molecular oncology. 2014.

COUFALOVÁ, Dominika, Michal ĎURECH, Filip TRČKA, Petr MÜLLER, Bořivoj VOJTĚŠEK and Lenka HERNYCHOVÁ. Utilization of HDX Workbench software for evaluation of H/D data obtained from Orbitrap Elitemass spectrometer. In 4th Symposium on Structural Proteomics 2014. 2014.

PJECHOVÁ, Mariana, Lenka HERNYCHOVÁ, Peter TOMAŠEC and Bořivoj VOJTĚŠEK. Analysis of pro-inflammatory effects of replication- deficient adenovirus vectors by quantitative proteomics. In “4th RECAMO joint meeting – Through cancer research towards applied molecular oncology.”. 2013. ISBN 978-80-86793-28-3.

PJECHOVÁ, Mariana, Lenka HERNYCHOVÁ, Peter TOMAŠEC and Bořivoj VOJTĚŠEK. Study of pro-inflammatory properties of adenovirus vectors. In PRIME-XS Workshop on Phosphopeptide enrichment, labeling strategies and proteomics data analysis. 2013.

PJECHOVÁ, Mariana, Lenka HERNYCHOVÁ, Peter TOMAŠEC and Bořivoj VOJTĚŠEK. Využitie kvantitatívno- proteomickej analýzy pri štúdiu imunomodulačných vlastností adenovírusových vektorov. In 3. konference České společnosti pro hmotnostnou spektrometrii. 2013. ISBN 978-80-905045-3-0.

HERNYCHOVÁ, Lenka, Marta NEKULOVÁ, David POTĚŠIL, Eva MICHALOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Bořivoj VOJTĚŠEK and Jitka HOLČÁKOVÁ. A combined immunoprecipitation and mass spectrometric approach to determine deltaNp63-interacting partners. Klinická onkologie. 2012, vol. 25, supplementum 2, p. "2S64"-"2S69", 6 pp. ISSN 0862-495X.

BOUCHALOVÁ, Pavla, Pavel BOUCHAL, Alexander SCHERL, David POTĚŠIL, Lenka HERNYCHOVÁ, Bořivoj VOJTĚŠEK and Roman HRSTKA. Identification of AGR2 partners using mass spectrometry with label-free quantification. In 3rd RECAMO joint meeting: Role of p53, MDM2, AGR2/3 and ubiquitin/chaperone systems in tumour biology. 2012.

HOLČÁKOVÁ, Jitka, Marta NEKULOVÁ, Lenka HERNYCHOVÁ, Paulina ORZOL, Philip COATES and Bořivoj VOJTĚŠEK. The role of p63 expression in human breast cancer cells. In International Journal of Molecular Medicine. 2012.

STRUHÁROVÁ, Iva, Pavel BOUCHAL, Jiří JARKOVSKÝ, Kristýna HRAZDILOVÁ, Monika DVOŘÁKOVÁ, Lenka HERNYCHOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, Petr SOVA and Bořivoj VOJTĚŠEK. An induction of Retinol Binding Protein 4 by new platinum-based anticancer agent LA-12. In "2nd RECAMO joint meeting": Role of p53, MDM2, AGR2/3 and ubiquitin/chaperone system in tumour biology. 2011. ISBN 978-80-86793-20-7.

DVOŘÁKOVÁ, Monika, Petr MÜLLER, Lenka HERNYCHOVÁ, Spiros D. GARBIS, Rudolf NENUTIL, Bořivoj VOJTĚŠEK and Pavel BOUCHAL. Identification and functional studies on proteins involved in in low-grade breast cancer metastasis. In Computional mass spectrometry-based proteomics. 2011.

STRUHÁROVÁ, Iva, Pavel BOUCHAL, Jiří JARKOVSKÝ, Kristýna HRAZDILOVÁ, Monika DVOŘÁKOVÁ, Lenka HERNYCHOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, Petr SOVA and Bořivoj VOJTĚŠEK. The new platinum anticancer agent LA-12 induces Retinol Bionding Protein 4 in vivo. In 5th European Summer School in "Proteomics Basics". 2011.

BOUCHAL, Pavel, Jiří JARKOVSKÝ, Kristýna HRAZDILOVÁ, Monika DVOŘÁKOVÁ, Iva STRUHÁROVÁ, Lenka HERNYCHOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, Petr SOVA and Bořivoj VOJTĚŠEK. The new platinum-based anticancer agent LA-12 induces retinol binding protein 4 in vivo. Proteome Science. BioMed Central, 2011, vol. 9, No 68, p. "nestránkováno", 9 pp. ISSN 1477-5956. Available from: https://dx.doi.org/10.1186/1477-5956-9-68.

BOUCHAL, Pavel, Monika MUDROCHOVÁ, Theodoros ROUMELIOTIS, Lenka HERNYCHOVÁ, Roman HRSTKA, Spiros D. GARBIS, Rudolf NENUTIL and Bořivoj VOJTĚŠEK. Biomarker discovery in low grade breast cancer: A proteomics based approach. In 4th EU-Summer School in Proteomics Basics: "High-Throughput Dana Analysis and Statistics". Brixen/Bressanone, Italy, August 1-7, 2010. 2010.

BOUCHAL, Pavel, Monika MUDROCHOVÁ, Zbyněk BORTLÍČEK, Theodoros ROUMELIOTIS, Eva BUDINSKÁ, Dominika VÁŇOVÁ, Lenka HERNYCHOVÁ, Iva STRUHÁROVÁ, Roman HRSTKA, Petr MÜLLER, Alexander SCHERL, Spiros D. GARBIS, Rudolf NENUTIL and Bořivoj VOJTĚŠEK. Biomarker discovery in low-grade breast cancer: An integrated, proteomics-based approach. In Abstract book of "3rd joint meeting on the role of p53, MDM2, AGR2/3 and ubiquitin/chaperone system in tumour biology". 2010. ISBN 978-80-86793-16-0.

BOUCHAL, Pavel, Monika MUDROCHOVÁ, Eva BUDINSKÁ, Zbyněk BORTLÍČEK, Iva STRUHÁROVÁ, Lenka HERNYCHOVÁ, Theodoros ROUMELIOTIS, Spiros D. GARBIS, Roman HRSTKA, Petr MÜLLER, Rudolf NENUTIL and Bořivoj VOJTĚŠEK. Biomarkers of lymph node metastasis in low-grade breast cancer: An integrated, proteomics-based approach. In XXII. Biochemický zjazd: The Book of Abstracts. 2010. ISBN 978-80-88866-83-1.

BOUCHAL, Pavel, Monika MUDROCHOVÁ, Iva STRUHÁROVÁ, Theodoros ROUMELIOTIS, Lenka HERNYCHOVÁ, Roman HRSTKA, Spiros D. GARBIS, Rudolf NENUTIL and Bořivoj VOJTĚŠEK. Biomarkers of metastatic potential in low grade breast cancer. 2010.

BOUCHAL, Pavel, Roman HRSTKA, Lenka HERNYCHOVÁ, Marek LINK, Vojtěch TAMBOR, Pavlína HOLEŠÍNSKÁ and Bořivoj VOJTĚŠEK. Quantitative proteomic analysis of lung carcinoma cell line transfected by mutant p53 gene sequences. In 2009 Swiss Proteomics Society Meeting: "Proteome Dynamics: Protein Quantification in Time and Space". 2009.

HOLČÁKOVÁ, Jitka, Lenka HERNYCHOVÁ, Pavel BOUCHAL, Kristýna BROŽKOVÁ, Jan ŽALOUDÍK, Dalibor VALÍK, Rudolf NENUTIL and Bořivoj VOJTĚŠEK. Identification of alphaB-crystallin, a biomarker of renal cell carcinoma by SELDI-TOF MS. The International Journal of Biological Markers. Itálie: Wichtig editore, 2008, vol. 23, No 1, p. 48-53. ISSN 0393-6155.

BROŽKOVÁ, Kristýna, Eva BUDINSKÁ, Pavel BOUCHAL, Lenka HERNYCHOVÁ, Dana KNOFLÍČKOVÁ, Dalibor VALÍK, Rostislav VYZULA, Bořivoj VOJTĚŠEK and Rudolf NENUTIL. Surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight proteomic profiling of breast carcinomas identifies clinicopathologically relevant groups of patients similar to previously defined clusters from cDNA expression. Breast Cancer Research. London, Great Britain: Biomed Central Ltd., 2008, vol. 10, No 3, p. R48, 11 pp. ISSN 1465-5411. Available from: https://dx.doi.org/10.1186/bcr2101.

BOUCHAL, Pavel, Lenka HERNYCHOVÁ, Monika MUDROCHOVÁ, Kristýna BROŽKOVÁ, Jarmila SOBOTKOVÁ, Spiros D. GARBIS, Petr NOVÁK, Rostislav VYZULA, Rudolf NENUTIL and Bořivoj VOJTĚŠEK. The ways leading to identification of potential biomarkers in SELDI-TOF MS based proteomic studies. In 8th Siena Meeting: From Genome To Proteome: Integration and Proteome Completion. Siena, Italy: The University of Siena, 2008, p. 153.

BROŽKOVÁ, Kristýna, Dana KNOFLÍČKOVÁ, Lenka HERNYCHOVÁ, Pavel BOUCHAL, Jitka HOLČÁKOVÁ, Eva MICHALOVÁ, Rostislav VYZULA, Jan ŽALOUDÍK, Dalibor VALÍK, Rudolf NENUTIL and Bořivoj VOJTĚŠEK. Identifikace potenciálních biomarkerů karcinomů prsu metodou SELDI-TOF MS (Identification of potencial biomarkers of breast cancer by SELDI-TOF MS). Klinická onkologie. Brno: Česká lékařská společnost J. E. Purkyně, 2007, vol. 20, No 6, p. 377-383. ISSN 0862-495X.

EYER, Luděk, Roman PANTŮČEK, Zbyněk ZDRÁHAL, Hana KONEČNÁ, Petr KAŠPÁREK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Lenka HERNYCHOVÁ, Jan PREISLER and Jiří DOŠKAŘ. Structural protein analysis of the polyvalent staphylococcal bacteriophage 812. Proteomics. Weinheim: Wiley-VCH, 2007, vol. 7, No 1, p. 64-72. ISSN 1615-9853.

EYER, Luděk, Roman PANTŮČEK, Zbyněk ZDRÁHAL, Hana KONEČNÁ, Petr KAŠPÁREK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Lenka HERNYCHOVÁ, Jan PREISLER and Jiří DOŠKAŘ. Structural proteins of the polyvalent staphylococcal bacteriophage 812. In XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků. Brno: Masarykova univerzita, 2007, p. 22-23. ISBN 978-80-210-4234-6.

EYER, Luděk, Zbyněk ZDRÁHAL, Hana KONEČNÁ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Jan PREISLER, Lenka HERNYCHOVÁ and Jiří DOŠKAŘ. Proteom polyvalentního stafylokokového bakteriofága (Proteome of the polyvalent staphylococcal bacteriophage). In X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Masarykova univerzita, 2006, p. 62. ISBN 80-210-3942-6.

EYER, Luděk, Zbyněk ZDRÁHAL, Ondrej ŠEDO, Hana KONEČNÁ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Jan PREISLER, Lenka HERNYCHOVÁ and Jiří DOŠKAŘ. Proteom polyvalentního stafylokokového bakteriofága 812 (Proteome of the polyvalent staphylococcal bacteriophage 812). In SIROTIAK, Maroš. Študentská vedecká konferencia 2006. Zborník recenzovaných príspevkov - biologická a environmentálna sekcia. 1. zväzok. Bratislava: Univerzita Komenského v Bratislave, KARTPRINT, 2006, p. 41-43. ISBN 80-88870-58-5.

DOŠKAŘ, Jiří, Luděk EYER, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Hana KONEČNÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Lenka HERNYCHOVÁ and Jan PREISLER. Proteomic characterization of the polyvalent staphylophage 812. In 12th International Symposium on Staphylococci & Staphylococcal Infections. 2006.