Bakalářská práce

Přenos chemického signálu na úrovni Axinu: Přesměrování signálu prostřednictvím inhibitorů specifických protein-proteinových interakcí.

Transduction of the chemical signal through Axin scafoldosome. Re-routing of signalling via interference with specific protein-protein interactions.

Pavlína Víšková
Anotace

Scaffold proteiny slouží jako „lešení“ zprostředkovávající vazbu mnoha proteinových komponent různých signálních drah. Zablokováním vazby dané signální molekuly na scaffold protein je možné signální dráhy uměle regulovat – zapnout/vypnout, případně vynutit přepnutí do jiné signální kaskády. V této práci jsme se snažili prokázat možnost regulace signální dráhy Wnt na modelu interakce scaffold proteinu …více

Abstract

Scaffold proteins serve as platforms for various protein components of different signaling pathways. By blocking the binding of a chosen signaling component on a scaffold protein, one can possibly regulate the signaling networks – turn them on/off and thereby change the direction of the signal flow. In this work we tried to show the possibility to regulate the Wnt signaling pathway by specific disruption …více

Klíčová slova
Axin Kasein kináza 1ε signální dráha Wnt transkripční faktor c-Myc RNA interference scaffold protein Casein Kinase 1ε Wnt signaling pathway c-Myc transcription factor
Zadání práce
V teoretické části bakalářské práce student provede literární rešerši na téma "Úloha protein-proteinových interakcí v přenosu chemického signálu na úrovni Axinu". V experimentální části práce se student zaměří na přípravu a selekci monoklonální stabilní buněčné linie, s inducibilní expresí RNAi konstruktu pro potlačení exprese endogenního Axinu (tzv. "RNAi knock-down"). V pozadí snížené hladiny endogenního Axinu bude testovat vliv delece vazebných míst pro CK1e a c-Myc na signalizaci prostřednictvím dráhy Wnt a c-Myc destrukčního komplexu. V průběhu práce si student osvojí metody kultivace savčích buněk, exprese proteinů v buněčných kulturách, stanovení hladiny mRNA metodou RT-qPCR a luciferázový reporterový-systém. Doporučená literatura: 1) Arnold et al. The Axin1 scaffold protein promotes formation of a degradation complex for c-Myc EMBO J. 28, 500-512 (2009) 2) Cortese et al. Intrinsic disorder in scaffold proteins: getting more from less. Prog. Biophys. Mol. Biol. 98, 85-106 (2008) 3) Good et al. Scaffold proteins: Hubs for controlling of the flow of cellular information.Science 332, 680-686 (2011) 4) McDonald et al. Wnt/b-catenine signaling: components, mechanisms, and diseases. Dev Cell. 17, 9-26 (2009) 5) Zhang et al. Mechanistic insight intoMyc stabilisation in breast cancer involving aberrant Axin1 expression. PNAS. 109, 2790-2795 (2012)
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
19. 5. 2015 16:19, doc. Mgr. Lukáš Trantírek, Ph.D., učo 8725
Plný text práce
2,2 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
18. 6. 2015
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Lukáš Trantírek, Ph.D., učo 8725
NekGen CSB CEITEC MU

Oponent

Mgr. Milan Ešner, Ph.D., učo 8805

Konzultant

Mgr. Jan Ryneš, Ph.D., učo 119705
NekGen CSB CEITEC MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.