Jedním ze zásadních prostředků evolučního boje mezí bakteriofágy a jejich hostiteli je využívání modifikovaných bází. Významným problémem studia epigenomu je však už samotná detekce těchto modifikací. Mnohé dosavadní metody umožňují detekci jen některých typů modifikací, typicky metylací cytosinu, nebo jsou velmi časově náročné a vyžadují celou řadu chemických reakcí. Sekvenování třetí generace využívající nanopóry však umožňuje detekci epigenetických modifikací DNA i RNA v reálném čase, a díky neustálému trénování detekčních algoritmů se významně rozšiřuje i spektrum modifikací, jež lze rozlišit. Bakalářská práce se zaměří na představení obranných strategií a regulačních mechanismů fágů a jejich bakteriálních hostitelů založených na epigenomu. Dále budou popsány principy jeho detekce různými sekvenačními platformami se zaměřením na platformu Oxford Nanopore. Student také představí a porovná programy vhodné pro detekci a analýzu epigenomu. Práce bude vypracována formou literární rešerše.